More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1697 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
1795 aa  3449    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  84.49 
 
 
2105 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.94 
 
 
1073 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  43.35 
 
 
1076 aa  444  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  46.03 
 
 
2796 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.55 
 
 
1052 aa  410  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  46.88 
 
 
1355 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.56 
 
 
647 aa  364  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  42.74 
 
 
592 aa  344  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.53 
 
 
539 aa  339  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  43.25 
 
 
539 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.01 
 
 
592 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  43.54 
 
 
1587 aa  317  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  43.19 
 
 
533 aa  315  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.83 
 
 
940 aa  303  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  37.86 
 
 
1322 aa  299  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.18 
 
 
980 aa  297  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  38.56 
 
 
576 aa  295  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  40.23 
 
 
546 aa  294  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  41.19 
 
 
2182 aa  290  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  41.46 
 
 
600 aa  288  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50.24 
 
 
946 aa  288  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  42.37 
 
 
2701 aa  283  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  54.14 
 
 
341 aa  279  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.13 
 
 
586 aa  278  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
790 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 
802 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 
788 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  39.14 
 
 
498 aa  274  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.95 
 
 
788 aa  274  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.57 
 
 
821 aa  272  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.18 
 
 
1279 aa  272  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.25 
 
 
774 aa  271  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.63 
 
 
788 aa  270  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  35.48 
 
 
575 aa  270  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.09 
 
 
810 aa  269  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.47 
 
 
788 aa  267  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.14 
 
 
788 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
788 aa  266  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
788 aa  266  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
629 aa  266  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.97 
 
 
788 aa  265  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.97 
 
 
583 aa  265  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  36.04 
 
 
633 aa  264  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
1534 aa  264  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38.62 
 
 
567 aa  263  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.15 
 
 
788 aa  263  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  37.88 
 
 
551 aa  262  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  39.96 
 
 
2954 aa  261  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  34.56 
 
 
635 aa  261  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.26 
 
 
1532 aa  259  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  52.96 
 
 
341 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.29 
 
 
1363 aa  257  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  35.85 
 
 
857 aa  254  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.81 
 
 
2668 aa  250  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  33.59 
 
 
600 aa  250  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  53.82 
 
 
615 aa  250  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  33.07 
 
 
802 aa  250  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  34.67 
 
 
622 aa  250  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 
9867 aa  248  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 
598 aa  248  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  34.98 
 
 
624 aa  248  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  47.83 
 
 
526 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  50.48 
 
 
460 aa  246  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  36.53 
 
 
627 aa  244  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  36.48 
 
 
501 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
624 aa  242  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  36.28 
 
 
624 aa  242  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.48 
 
 
3954 aa  241  9e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
624 aa  241  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  44.82 
 
 
595 aa  241  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  39.56 
 
 
1400 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
624 aa  236  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  38.13 
 
 
506 aa  233  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  32.66 
 
 
601 aa  231  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.05 
 
 
2775 aa  229  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 
965 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  33.21 
 
 
600 aa  226  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.81 
 
 
2678 aa  226  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  32.89 
 
 
624 aa  225  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  33.89 
 
 
624 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  35.28 
 
 
624 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.64 
 
 
2689 aa  223  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  33.71 
 
 
624 aa  223  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.06 
 
 
3427 aa  223  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 
363 aa  221  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.21 
 
 
2667 aa  220  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  31.53 
 
 
589 aa  218  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  30.82 
 
 
622 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  47.22 
 
 
460 aa  215  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  58.45 
 
 
686 aa  212  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.84 
 
 
599 aa  211  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  32.48 
 
 
589 aa  211  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
598 aa  211  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  30.66 
 
 
621 aa  210  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  37.86 
 
 
613 aa  211  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 
4800 aa  209  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.46 
 
 
1164 aa  209  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  45.11 
 
 
4334 aa  206  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 
597 aa  205  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>