More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3408 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 547 aa  1088    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.85 
 
 		 3427 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  54.89 
 
 		 1175 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1804  hypothetical protein  46.12 
 
 		 247 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  51.15 
 
 		 917 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  50.54 
 
 		 652 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.15 
 
 		 1372 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  50.26 
 
 		 709 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  48.33 
 
 		 1022 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  48.33 
 
 		 1017 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0007  hypothetical protein  41.2 
 
 		 255 aa  136  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  42.5 
 
 		 1346 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.91 
 
 		 1055 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  43.2 
 
 		 1037 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.44 
 
 		 1019 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  45.81 
 
 		 813 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.95 
 
 		 588 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.41 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.83 
 
 		 2346 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.23 
 
 		 1180 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  46.81 
 
 		 4106 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.02 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  51.72 
 
 		 8321 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  39.61 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.41 
 
 		 2194 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3756  integrins alpha chain  47.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.23 
 
 		 1009 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.51 
 
 		 2701 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  37.8 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.87 
 
 		 2567 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.41 
 
 		 1340 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.94 
 
 		 1225 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  43.62 
 
 		 3314 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  50 
 
 		 4285 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 		 2704 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.39 
 
 		 1222 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.86 
 
 		 1012 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 		 946 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  40.46 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.56 
 
 		 2305 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.59 
 
 		 891 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.88 
 
 		 2310 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.72 
 
 		 1164 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40.78 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.38 
 
 		 1118 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  40.59 
 
 		 3209 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.4 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 1072 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.16 
 
 		 889 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.86 
 
 		 1113 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  43.14 
 
 		 998 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  34.13 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.61 
 
 		 2239 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 6662 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 6683 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 6779 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44.83 
 
 		 2452 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  49.38 
 
 		 1883 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.27 
 
 		 1800 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.57 
 
 		 1895 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.29 
 
 		 982 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  34.59 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 260 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  36.6 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.5 
 
 		 1553 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.76 
 
 		 1079 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.67 
 
 		 5839 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19291  hypothetical protein  50 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  41 
 
 		 4836 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  43.96 
 
 		 1202 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.35 
 
 		 4687 aa  64.7  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1538 aa  64.3  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  47.89 
 
 		 2537 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19271  hypothetical protein  50 
 
 		 693 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.89 
 
 		 1145 aa  63.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  50 
 
 		 1594 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.25 
 
 		 2678 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  34.18 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.05 
 
 		 3619 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.77 
 
 		 5962 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.57 
 
 		 3396 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.14 
 
 		 2067 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.94 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.57 
 
 		 1963 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.12 
 
 		 1839 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.78 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  36.29 
 
 		 313 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 		 329 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  40.86 
 
 		 2689 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  41.32 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  42.25 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.74 
 
 		 3168 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 9867 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 1287 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>