46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4891 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  96.68 
 
 		 3427 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  48.81 
 
 		 938 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  47.9 
 
 		 940 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  47.92 
 
 		 3193 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  43.95 
 
 		 922 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.58 
 
 		 1019 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  38.31 
 
 		 4465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.07 
 
 		 9867 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  41.78 
 
 		 1838 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 1017 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  37.87 
 
 		 1022 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 8980 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.92 
 
 		 813 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  37.95 
 
 		 2853 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  35.44 
 
 		 8871 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  39.38 
 
 		 2001 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  36.99 
 
 		 2132 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.71 
 
 		 2133 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 		 14916 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  33.54 
 
 		 3132 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  39.07 
 
 		 2820 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  36.47 
 
 		 917 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.93 
 
 		 16311 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  38.1 
 
 		 2461 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.33 
 
 		 3089 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 12741 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.88 
 
 		 3508 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.15 
 
 		 3714 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.93 
 
 		 3363 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.58 
 
 		 6678 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 3954 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  32.93 
 
 		 3391 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  37.42 
 
 		 492 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.03 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 		 1855 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  31.51 
 
 		 3066 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.27 
 
 		 4334 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.24 
 
 		 824 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  30.14 
 
 		 2802 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.95 
 
 		 7284 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  26.21 
 
 		 4120 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  34.44 
 
 		 1143 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  25.9 
 
 		 3834 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  24.12 
 
 		 2024 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1151 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>