163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0392 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  62.8 
 
 		 2853 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  68.26 
 
 		 2132 aa  1242    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  100 
 
 		 2001 aa  3875    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  62.8 
 
 		 2820 aa  701    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  40.84 
 
 		 4231 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  48.41 
 
 		 3598 aa  358  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  33.65 
 
 		 4465 aa  343  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.04 
 
 		 11716 aa  344  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.91 
 
 		 3544 aa  259  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  35.18 
 
 		 3699 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.93 
 
 		 3699 aa  245  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.01 
 
 		 3391 aa  215  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.77 
 
 		 2522 aa  196  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  50.98 
 
 		 2701 aa  189  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45 
 
 		 2954 aa  174  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  55.1 
 
 		 8871 aa  166  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  41.48 
 
 		 2337 aa  160  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  38.81 
 
 		 1728 aa  155  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  38.8 
 
 		 3132 aa  149  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.68 
 
 		 2839 aa  146  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.89 
 
 		 14916 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  36.42 
 
 		 2060 aa  143  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.65 
 
 		 2678 aa  143  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.67 
 
 		 1055 aa  141  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  35.58 
 
 		 991 aa  136  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  30.38 
 
 		 8980 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.89 
 
 		 5020 aa  131  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  47.06 
 
 		 16311 aa  132  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  31.42 
 
 		 3066 aa  129  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  31.69 
 
 		 2127 aa  128  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  33.13 
 
 		 2233 aa  128  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  29.23 
 
 		 1757 aa  127  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  45.71 
 
 		 2461 aa  127  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  38.41 
 
 		 6678 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  40 
 
 		 1838 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  40.85 
 
 		 2133 aa  124  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.07 
 
 		 3363 aa  121  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.32 
 
 		 9867 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  34.33 
 
 		 998 aa  121  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  31.27 
 
 		 962 aa  120  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 		 3954 aa  119  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.31 
 
 		 4334 aa  119  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 1855 aa  118  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  41.85 
 
 		 2153 aa  119  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  39.38 
 
 		 337 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  37.45 
 
 		 12741 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.43 
 
 		 1019 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.06 
 
 		 3474 aa  114  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.35 
 
 		 3427 aa  113  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.38 
 
 		 2807 aa  112  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  43.45 
 
 		 922 aa  111  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  38.44 
 
 		 2079 aa  110  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  44.63 
 
 		 3209 aa  109  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  43.66 
 
 		 938 aa  105  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  55.45 
 
 		 2182 aa  104  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  31 
 
 		 3508 aa  104  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.4 
 
 		 2715 aa  103  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.68 
 
 		 2402 aa  103  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  36.46 
 
 		 2802 aa  100  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  41.62 
 
 		 2476 aa  100  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  42.25 
 
 		 940 aa  100  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.95 
 
 		 2503 aa  99  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  36.3 
 
 		 3244 aa  99.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  31.9 
 
 		 426 aa  97.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  34.08 
 
 		 2506 aa  97.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 		 1610 aa  96.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.73 
 
 		 4978 aa  96.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  36.43 
 
 		 824 aa  94  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  35.05 
 
 		 3714 aa  92.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  37.02 
 
 		 731 aa  91.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  34.54 
 
 		 3222 aa  90.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  36.74 
 
 		 683 aa  91.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.01 
 
 		 3477 aa  90.5  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  43.22 
 
 		 1610 aa  89.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  27.1 
 
 		 2145 aa  89.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  47.32 
 
 		 5769 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  33.99 
 
 		 2567 aa  88.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  39.62 
 
 		 3230 aa  88.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  29.62 
 
 		 5094 aa  88.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.55 
 
 		 3089 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.59 
 
 		 2656 aa  86.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  40.51 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  30.75 
 
 		 1779 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  39.18 
 
 		 1699 aa  84  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.68 
 
 		 2816 aa  80.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  39.84 
 
 		 3193 aa  80.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  33.78 
 
 		 917 aa  80.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  29.47 
 
 		 3927 aa  80.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.96 
 
 		 8321 aa  79.7  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  47.66 
 
 		 3026 aa  78.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  49.5 
 
 		 1342 aa  78.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  26.78 
 
 		 1428 aa  77  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 		 1017 aa  76.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 		 1022 aa  75.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  38.6 
 
 		 5218 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.03 
 
 		 3542 aa  75.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.44 
 
 		 3758 aa  73.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  29.53 
 
 		 4120 aa  71.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.38 
 
 		 2074 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  25.3 
 
 		 893 aa  69.7  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.457642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>