116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3053 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  36.53 
 
 		 1779 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  100 
 
 		 3244 aa  6154    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  80.51 
 
 		 2079 aa  3121    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 		 3699 aa  517  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.79 
 
 		 3544 aa  510  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 3699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  35.4 
 
 		 4231 aa  474  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.03 
 
 		 11716 aa  446  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.24 
 
 		 4465 aa  366  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  36.59 
 
 		 2853 aa  355  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  36.34 
 
 		 2820 aa  345  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.43 
 
 		 2402 aa  337  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.91 
 
 		 3474 aa  209  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  32.83 
 
 		 2636 aa  206  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.65 
 
 		 9867 aa  177  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.91 
 
 		 3563 aa  173  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.4 
 
 		 2522 aa  164  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.42 
 
 		 3927 aa  160  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.94 
 
 		 1884 aa  153  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.95 
 
 		 3598 aa  147  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.5 
 
 		 5787 aa  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  55.88 
 
 		 672 aa  131  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 		 1867 aa  123  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  26.13 
 
 		 2890 aa  123  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  30.01 
 
 		 1631 aa  119  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  29.82 
 
 		 683 aa  111  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  38.42 
 
 		 2001 aa  111  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.12 
 
 		 2656 aa  109  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1879 aa  109  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  34.8 
 
 		 1672 aa  107  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.34 
 
 		 2074 aa  106  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  51.14 
 
 		 788 aa  105  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  50.25 
 
 		 753 aa  102  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  45.76 
 
 		 494 aa  99.8  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.75 
 
 		 2839 aa  97.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  23.81 
 
 		 4848 aa  96.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.33 
 
 		 887 aa  95.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  47.22 
 
 		 1148 aa  90.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.4 
 
 		 1428 aa  89.4  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.99 
 
 		 2503 aa  88.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.06 
 
 		 1673 aa  88.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 2476 aa  87  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  35.64 
 
 		 731 aa  86.7  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.1 
 
 		 962 aa  83.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  27.08 
 
 		 2233 aa  80.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  58.25 
 
 		 622 aa  80.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  29.12 
 
 		 5020 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.29 
 
 		 815 aa  79.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.72 
 
 		 3542 aa  78.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  37.93 
 
 		 2506 aa  77  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.37 
 
 		 1011 aa  74.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  61.45 
 
 		 824 aa  73.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  53.75 
 
 		 840 aa  71.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  51.46 
 
 		 884 aa  70.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  34.13 
 
 		 1232 aa  70.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 		 994 aa  68.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.3 
 
 		 2507 aa  68.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.85 
 
 		 8321 aa  65.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  32.46 
 
 		 1025 aa  65.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 		 1092 aa  64.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  25.17 
 
 		 2377 aa  64.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.57 
 
 		 3191 aa  64.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.66 
 
 		 933 aa  64.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  59.26 
 
 		 1016 aa  64.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  31.96 
 
 		 1222 aa  63.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  31.21 
 
 		 1544 aa  63.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  56.32 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  28.15 
 
 		 989 aa  62.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  32.33 
 
 		 2831 aa  62.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  26.46 
 
 		 1126 aa  62  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  50.94 
 
 		 710 aa  62  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1002 aa  61.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.18 
 
 		 3911 aa  60.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.47 
 
 		 674 aa  60.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  29.2 
 
 		 2169 aa  58.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  26.31 
 
 		 3391 aa  58.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 		 850 aa  57.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  32.91 
 
 		 1421 aa  57  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  29.02 
 
 		 1134 aa  56.6  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  58.11 
 
 		 688 aa  56.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  33.1 
 
 		 797 aa  56.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  30 
 
 		 506 aa  55.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  26.72 
 
 		 892 aa  56.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.2 
 
 		 1072 aa  55.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  30.8 
 
 		 2153 aa  55.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.96 
 
 		 692 aa  54.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.27 
 
 		 2713 aa  53.9  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  24.34 
 
 		 2027 aa  53.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1750 aa  53.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1124 aa  52.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.65 
 
 		 778 aa  52.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  31.82 
 
 		 1870 aa  52  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1022 aa  51.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  35.98 
 
 		 2132 aa  52.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  45.24 
 
 		 1338 aa  51.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 		 1321 aa  51.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1949 aa  50.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.95 
 
 		 1626 aa  50.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  34.48 
 
 		 2271 aa  50.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  34.48 
 
 		 2271 aa  50.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>