54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3550 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  100 
 
 		 962 aa  1976    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.27 
 
 		 2001 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.4 
 
 		 2853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  31.74 
 
 		 2820 aa  119  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 		 4231 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.52 
 
 		 3598 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.4 
 
 		 11716 aa  95.1  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.71 
 
 		 2402 aa  91.3  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.37 
 
 		 3544 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  32.81 
 
 		 4465 aa  81.3  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  30.66 
 
 		 2132 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.85 
 
 		 2954 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 		 3699 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 		 3699 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.46 
 
 		 2522 aa  67.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.38 
 
 		 1152 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.57 
 
 		 3542 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 1081 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  24.8 
 
 		 1672 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  23.81 
 
 		 2506 aa  62  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.35 
 
 		 3563 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.35 
 
 		 1673 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.38 
 
 		 3911 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  24.3 
 
 		 1342 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  27.69 
 
 		 2701 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  28.86 
 
 		 731 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  25.85 
 
 		 1656 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  22.51 
 
 		 1728 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  29.23 
 
 		 2476 aa  52  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  36.96 
 
 		 5769 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 		 2839 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.05 
 
 		 1019 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.62 
 
 		 1222 aa  50.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  31.71 
 
 		 1055 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  30.19 
 
 		 660 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  30.1 
 
 		 660 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  33.01 
 
 		 2337 aa  48.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0871  hypothetical protein  36.99 
 
 		 628 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  31.01 
 
 		 5020 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.06 
 
 		 3474 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  34.48 
 
 		 874 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  25.78 
 
 		 2233 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1879 aa  47  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.05 
 
 		 887 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.43 
 
 		 1610 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4161  hypothetical protein  24.07 
 
 		 499 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  26.84 
 
 		 683 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 		 1610 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 		 2271 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 		 2271 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 664 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  25.17 
 
 		 1232 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  22.93 
 
 		 682 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3421  hypothetical protein  25.76 
 
 		 163 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>