More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1094 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  42.9 
 
 		 2853 aa  935    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  36.35 
 
 		 3699 aa  744    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  45.97 
 
 		 2820 aa  954    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  39.89 
 
 		 4465 aa  1749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  37.52 
 
 		 3544 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.64 
 
 		 3699 aa  742    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 11716 aa  22940    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  46.46 
 
 		 4231 aa  1680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  53.53 
 
 		 1434 aa  565  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  55.25 
 
 		 702 aa  463  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  40.95 
 
 		 3598 aa  464  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  30.52 
 
 		 3244 aa  431  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  56.07 
 
 		 640 aa  414  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  46.45 
 
 		 621 aa  383  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  48.43 
 
 		 2001 aa  352  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  47.05 
 
 		 706 aa  338  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.19 
 
 		 2402 aa  318  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  49.2 
 
 		 1827 aa  285  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  30.78 
 
 		 2079 aa  274  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.77 
 
 		 3474 aa  268  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  34.43 
 
 		 2064 aa  264  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.35 
 
 		 2507 aa  249  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.75 
 
 		 2522 aa  241  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  35.46 
 
 		 811 aa  238  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  34 
 
 		 819 aa  223  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.65 
 
 		 3927 aa  201  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.79 
 
 		 1779 aa  193  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  51 
 
 		 2701 aa  188  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  49.27 
 
 		 2132 aa  186  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.09 
 
 		 5020 aa  173  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  39.39 
 
 		 1728 aa  170  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  41.4 
 
 		 2924 aa  169  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  31.98 
 
 		 1437 aa  166  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  25.98 
 
 		 3563 aa  165  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  37.14 
 
 		 2337 aa  163  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.06 
 
 		 2954 aa  163  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  34.5 
 
 		 503 aa  162  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.49 
 
 		 1884 aa  162  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  36.13 
 
 		 937 aa  160  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.72 
 
 		 1073 aa  154  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 		 1348 aa  152  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 		 2555 aa  142  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  32.33 
 
 		 1337 aa  142  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  29.98 
 
 		 1346 aa  142  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.56 
 
 		 2839 aa  139  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  29.63 
 
 		 752 aa  138  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  31.66 
 
 		 1433 aa  138  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  24.06 
 
 		 8321 aa  133  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  24.71 
 
 		 2334 aa  130  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.87 
 
 		 749 aa  130  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.86 
 
 		 2656 aa  124  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  32.24 
 
 		 935 aa  122  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  32.88 
 
 		 885 aa  122  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.91 
 
 		 4978 aa  122  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  31.62 
 
 		 2233 aa  120  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  37.69 
 
 		 6678 aa  119  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  43.93 
 
 		 1143 aa  116  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.52 
 
 		 8871 aa  116  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.45 
 
 		 5745 aa  115  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  34.78 
 
 		 3378 aa  114  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.74 
 
 		 2503 aa  114  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.29 
 
 		 4848 aa  110  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.27 
 
 		 4285 aa  110  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  42.78 
 
 		 1610 aa  109  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.8 
 
 		 2182 aa  109  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  49.04 
 
 		 1055 aa  108  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  35.59 
 
 		 2476 aa  107  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.72 
 
 		 1126 aa  105  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  28.2 
 
 		 1672 aa  103  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  27.27 
 
 		 912 aa  103  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.9 
 
 		 5098 aa  102  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.12 
 
 		 1019 aa  101  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  33.73 
 
 		 5769 aa  101  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  34.17 
 
 		 927 aa  100  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  28 
 
 		 683 aa  100  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  39.38 
 
 		 496 aa  100  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.48 
 
 		 3209 aa  99  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1879 aa  98.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  47.86 
 
 		 1610 aa  98.2  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  29.86 
 
 		 3542 aa  97.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.55 
 
 		 1428 aa  97.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  36.19 
 
 		 2715 aa  97.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.78 
 
 		 994 aa  96.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  28.4 
 
 		 962 aa  95.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  36.47 
 
 		 2329 aa  94.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25.61 
 
 		 3259 aa  93.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  38.81 
 
 		 731 aa  92.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.65 
 
 		 1275 aa  92.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  32.27 
 
 		 2127 aa  92  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  43.09 
 
 		 3026 aa  90.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  36.36 
 
 		 5094 aa  90.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  41.61 
 
 		 1538 aa  89.7  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1046 aa  89  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.49 
 
 		 1673 aa  89.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 9867 aa  88.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  25.94 
 
 		 2454 aa  88.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  49.52 
 
 		 1342 aa  88.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1002 aa  87  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.62 
 
 		 1855 aa  86.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 		 1118 aa  86.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>