134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2050 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1437 aa  2892    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  44.95 
 
 		 1433 aa  1035    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  43.51 
 
 		 1346 aa  929    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  44.63 
 
 		 1337 aa  925    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  44.91 
 
 		 1348 aa  939    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  36.46 
 
 		 752 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  35.56 
 
 		 749 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  32.66 
 
 		 702 aa  195  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  33.54 
 
 		 1434 aa  177  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  34.03 
 
 		 621 aa  168  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 		 11716 aa  167  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  35.84 
 
 		 640 aa  166  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 2507 aa  162  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  33.42 
 
 		 1827 aa  161  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  35.47 
 
 		 937 aa  157  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 1668 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  32.1 
 
 		 706 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  40.49 
 
 		 501 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  41.42 
 
 		 1147 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  39.88 
 
 		 657 aa  125  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  40 
 
 		 646 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  37.21 
 
 		 324 aa  122  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  39.88 
 
 		 491 aa  119  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  39.31 
 
 		 336 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  31.21 
 
 		 885 aa  117  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1003 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  40.35 
 
 		 558 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  35.43 
 
 		 757 aa  116  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1029 aa  116  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  39.16 
 
 		 700 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  34.38 
 
 		 634 aa  112  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.75 
 
 		 665 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.43 
 
 		 1073 aa  110  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  36.65 
 
 		 341 aa  109  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  36.09 
 
 		 495 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  38.24 
 
 		 541 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  33.9 
 
 		 1296 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  36.42 
 
 		 755 aa  106  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  36.75 
 
 		 1174 aa  105  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  30.06 
 
 		 2064 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  41.43 
 
 		 333 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  28.69 
 
 		 811 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  36.09 
 
 		 803 aa  101  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  30.8 
 
 		 500 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  30.9 
 
 		 503 aa  100  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.98 
 
 		 408 aa  99.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  36.53 
 
 		 571 aa  98.6  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  33.73 
 
 		 340 aa  97.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  29.3 
 
 		 819 aa  96.3  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  31.76 
 
 		 394 aa  95.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.75 
 
 		 933 aa  95.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  33.89 
 
 		 362 aa  95.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 		 1783 aa  93.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  32.34 
 
 		 371 aa  92.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1055 aa  91.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1318 aa  89.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.57 
 
 		 688 aa  89.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.73 
 
 		 1773 aa  89.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1294 aa  89.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  33.73 
 
 		 736 aa  89.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.61 
 
 		 1575 aa  88.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 601 aa  88.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.21 
 
 		 996 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.74 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  29.55 
 
 		 693 aa  85.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.43 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1263 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  34.32 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.72 
 
 		 571 aa  83.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.53 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  31.69 
 
 		 221 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.5 
 
 		 1797 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  30.98 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  44.32 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 725 aa  78.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 1015 aa  78.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.28 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.51 
 
 		 900 aa  75.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.75 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1215 aa  75.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  31.48 
 
 		 376 aa  73.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.52 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.31 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.98 
 
 		 876 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 404 aa  65.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.03 
 
 		 398 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  26.92 
 
 		 935 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  60.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  30.43 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  24.06 
 
 		 728 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.73 
 
 		 1139 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  27.93 
 
 		 367 aa  56.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1087 aa  56.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  33.75 
 
 		 458 aa  55.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 635 aa  55.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.36 
 
 		 627 aa  55.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.08 
 
 		 676 aa  55.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  55.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>