83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1942 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1013    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  43.14 
 
 
491 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  42.86 
 
 
755 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  41.88 
 
 
341 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  43.02 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  36.76 
 
 
1668 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40.45 
 
 
1433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  41.95 
 
 
1296 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  38.51 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  41.08 
 
 
1029 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  38.76 
 
 
657 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  40.49 
 
 
1437 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  39.55 
 
 
1003 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  37.22 
 
 
1147 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  34.16 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  35.39 
 
 
541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  41.1 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  35.68 
 
 
757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  36.87 
 
 
324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  34.83 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  36.46 
 
 
700 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  37.29 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  32.83 
 
 
371 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  37.5 
 
 
736 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  33.53 
 
 
408 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  56.18 
 
 
308 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 
1773 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  39.26 
 
 
543 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  34.35 
 
 
601 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  28.16 
 
 
558 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  32.97 
 
 
571 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  34.07 
 
 
996 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  37.06 
 
 
1294 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  34.55 
 
 
803 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  35.19 
 
 
634 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  32.72 
 
 
1174 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  36.36 
 
 
477 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  35.4 
 
 
1055 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  40.6 
 
 
1575 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
1797 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  33.14 
 
 
571 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.87 
 
 
933 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.71 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  34.72 
 
 
1215 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.93 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.73 
 
 
1015 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  32.53 
 
 
366 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.65 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  35.59 
 
 
1318 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  32.35 
 
 
725 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 
1783 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  32.34 
 
 
647 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.22 
 
 
687 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  30.23 
 
 
347 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
686 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  27.12 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  30.7 
 
 
846 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  32.53 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  29.8 
 
 
693 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.54 
 
 
900 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  34.15 
 
 
1263 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
701 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.42 
 
 
398 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  25.1 
 
 
876 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.99 
 
 
428 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  33.93 
 
 
367 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  25.51 
 
 
523 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  33.93 
 
 
254 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  33.04 
 
 
5166 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  36.7 
 
 
2112 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  29.03 
 
 
892 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  37.33 
 
 
416 aa  47.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  23.18 
 
 
1087 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  40.54 
 
 
919 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  30.71 
 
 
2604 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  28.33 
 
 
5517 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  37.5 
 
 
819 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.57 
 
 
5203 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.62 
 
 
4433 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
965 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
965 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>