89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6753 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1813    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  30.81 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1147 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  30.11 
 
 		 1433 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  31.18 
 
 		 646 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1294 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1029 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.98 
 
 		 1437 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  29.14 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30.69 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  29.63 
 
 		 1575 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.83 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  27.07 
 
 		 477 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  27.57 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  25.1 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1044 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.08 
 
 		 1668 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.63 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1215 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.72 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1048 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  25.74 
 
 		 1174 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 1783 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.12 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  32 
 
 		 1263 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  27.51 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  20.71 
 
 		 1084 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.75 
 
 		 694 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  31.33 
 
 		 362 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  25.79 
 
 		 341 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.89 
 
 		 1296 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1003 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  29.79 
 
 		 558 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  27.17 
 
 		 700 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.68 
 
 		 376 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.29 
 
 		 688 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1220 aa  55.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  25.93 
 
 		 725 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1043 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1318 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  30.66 
 
 		 541 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  27.22 
 
 		 736 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  30.05 
 
 		 495 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 701 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.92 
 
 		 803 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  27.13 
 
 		 996 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1060 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 757 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1054 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 		 1015 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1032 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  26.09 
 
 		 657 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  30.57 
 
 		 491 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.91 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1021 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.09 
 
 		 909 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.86 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  26.29 
 
 		 686 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1055 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.7 
 
 		 1773 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 221 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 999 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  25.22 
 
 		 404 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  25.22 
 
 		 404 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 983 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  24.5 
 
 		 365 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  28.43 
 
 		 543 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 931 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  19.74 
 
 		 780 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1090 aa  47.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1060 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  25.15 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.68 
 
 		 900 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1078 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25.11 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  28.22 
 
 		 523 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1082 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0028  hypothetical protein  27.5 
 
 		 543 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000206462  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 		 728 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  29.27 
 
 		 937 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  27.14 
 
 		 336 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1147 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1969 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  22.86 
 
 		 340 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  22.43 
 
 		 388 aa  44.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  22.43 
 
 		 388 aa  44.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  24.78 
 
 		 382 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  31.58 
 
 		 1116 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>