104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4027 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  96.47 
 
 
368 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  742    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  67.98 
 
 
382 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  67.45 
 
 
404 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  67.45 
 
 
404 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4638  putative glycosyl hydrolase  67.02 
 
 
377 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0454186  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  66.49 
 
 
385 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  66.14 
 
 
382 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  66.14 
 
 
382 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  66.14 
 
 
382 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  63.57 
 
 
388 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  63.57 
 
 
388 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  64.38 
 
 
365 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  60.99 
 
 
381 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  59.29 
 
 
363 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  60.71 
 
 
371 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  60.44 
 
 
367 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  59.73 
 
 
361 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  56.23 
 
 
369 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  55.96 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  54.86 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  54.79 
 
 
377 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.3 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  37.84 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.34 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.62 
 
 
361 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.28 
 
 
393 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  35.29 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.38 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.06 
 
 
371 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  32.43 
 
 
377 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3050  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.29 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  32.37 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.21 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  29.62 
 
 
371 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  32.71 
 
 
373 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3866  hypothetical protein  32.79 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.29 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  25.2 
 
 
608 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.14 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  25.47 
 
 
1060 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.12 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.12 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  22.41 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  22.41 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  22.59 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  24.26 
 
 
357 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  23.59 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  26.77 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  22.67 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.09 
 
 
652 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  28.52 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1044 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  22.37 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.51 
 
 
931 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  22.28 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  24.57 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.28 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  22.39 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.46 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  25 
 
 
1054 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  23.89 
 
 
1090 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  21.9 
 
 
1043 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.02 
 
 
597 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  23.05 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.61 
 
 
1082 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  22.64 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.3 
 
 
780 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  22.64 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  23.05 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.9 
 
 
1078 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  21.77 
 
 
1075 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.12 
 
 
1060 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.56 
 
 
999 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  24.81 
 
 
1048 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.75 
 
 
630 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.31 
 
 
757 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.29 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4586  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.61 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  22.3 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  24.5 
 
 
876 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  25.49 
 
 
934 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.54 
 
 
694 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  21.57 
 
 
1063 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  26.81 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25 
 
 
1032 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  20.52 
 
 
912 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5003  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.87 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.52 
 
 
1021 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  26.49 
 
 
925 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.96 
 
 
1041 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.93 
 
 
707 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>