90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0532 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1524    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  46.63 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  37.27 
 
 		 646 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  38.86 
 
 		 1003 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  35.15 
 
 		 495 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  37.89 
 
 		 1433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  34.07 
 
 		 324 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36 
 
 		 1437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  35.68 
 
 		 501 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1147 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  37.04 
 
 		 333 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  31.7 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  35.2 
 
 		 341 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  36.08 
 
 		 1296 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.43 
 
 		 1668 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  35.52 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  37.58 
 
 		 933 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  31.56 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  34.25 
 
 		 362 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.33 
 
 		 736 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  33.15 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  30.08 
 
 		 543 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  31.96 
 
 		 394 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.7 
 
 		 558 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  33.5 
 
 		 996 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.62 
 
 		 408 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  29.81 
 
 		 336 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  34.62 
 
 		 541 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  32.34 
 
 		 634 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  30 
 
 		 523 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 		 1783 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  30.56 
 
 		 371 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  30.72 
 
 		 657 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 		 1773 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.81 
 
 		 601 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  33.51 
 
 		 1174 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  34.62 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  30.41 
 
 		 340 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1055 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1294 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.5 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1263 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.77 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.11 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.32 
 
 		 477 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.66 
 
 		 570 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  27.55 
 
 		 728 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  31.25 
 
 		 221 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  41.57 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 		 1797 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  30.61 
 
 		 1575 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  26 
 
 		 1215 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.18 
 
 		 1015 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  29.19 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.03 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  25.43 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1087 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  26.26 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.69 
 
 		 876 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  26.52 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  29.31 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.73 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1898 aa  65.1  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  28.5 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.62 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  24.16 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.42 
 
 		 900 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1318 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  24.75 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1946 aa  61.6  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  29.11 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  24.36 
 
 		 667 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.07 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  23.03 
 
 		 702 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.25 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  25.58 
 
 		 719 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1441 aa  51.6  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.69 
 
 		 807 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  26.35 
 
 		 621 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0626  hypothetical protein  30.56 
 
 		 288 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  33.8 
 
 		 726 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1031 aa  47.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  25.52 
 
 		 702 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  23.6 
 
 		 850 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  22.34 
 
 		 545 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1093 aa  44.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  23.91 
 
 		 714 aa  44.3  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  43.9  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>