94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0821 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  100 
 
 		 1055 aa  2162    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1263 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  35.03 
 
 		 1296 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1318 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  42.28 
 
 		 308 aa  211  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1215 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1294 aa  168  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.26 
 
 		 1526 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  31.93 
 
 		 417 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.82 
 
 		 408 aa  105  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  33.58 
 
 		 2192 aa  104  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 		 1332 aa  103  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.3 
 
 		 1575 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.29 
 
 		 665 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1029 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1003 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.93 
 
 		 507 aa  98.2  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  29.67 
 
 		 799 aa  97.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  31.1 
 
 		 933 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.86 
 
 		 852 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  36.11 
 
 		 333 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.52 
 
 		 1174 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.07 
 
 		 755 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  34.64 
 
 		 362 aa  91.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  29.82 
 
 		 1668 aa  91.3  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  31.76 
 
 		 558 aa  91.3  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  32.53 
 
 		 1437 aa  91.3  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  35.4 
 
 		 501 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  30.06 
 
 		 341 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  34.16 
 
 		 340 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.03 
 
 		 743 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  33.14 
 
 		 371 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  32.2 
 
 		 646 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  30.81 
 
 		 736 aa  88.2  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  32 
 
 		 634 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  30.73 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  28.65 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 		 1773 aa  85.9  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  32.24 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.57 
 
 		 1755 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  28.74 
 
 		 491 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1147 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  32.12 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  39.04 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  34.07 
 
 		 700 aa  81.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  29.15 
 
 		 543 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  29.89 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.07 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1010 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.43 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  32.74 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  35.52 
 
 		 428 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 		 1783 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.67 
 
 		 1015 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  35.14 
 
 		 5453 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  41.67 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  31.71 
 
 		 1433 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  30.81 
 
 		 541 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  25.46 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  31.75 
 
 		 571 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  30.29 
 
 		 376 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  31.7 
 
 		 1092 aa  69.3  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  34.74 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  38.14 
 
 		 996 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  37.96 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  38.89 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  35.45 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.74 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.19 
 
 		 2031 aa  65.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  27.53 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.71 
 
 		 1797 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  34.69 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  26.39 
 
 		 775 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  28.18 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.6 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  28.73 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  36.11 
 
 		 398 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  36 
 
 		 366 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  23.82 
 
 		 693 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  26.26 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1106 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1087 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  25.95 
 
 		 728 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  27.04 
 
 		 1216 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 701 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  26.51 
 
 		 523 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.91 
 
 		 687 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  31.03 
 
 		 876 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  30.43 
 
 		 2990 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  35.34 
 
 		 149 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.33 
 
 		 1197 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>