75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1704 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 1755 aa  3499    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.87 
 
 		 2031 aa  380  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  32.19 
 
 		 1750 aa  138  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.11 
 
 		 852 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.33 
 
 		 2192 aa  102  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  25.98 
 
 		 1332 aa  99.8  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  29.79 
 
 		 743 aa  94.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  26.68 
 
 		 1092 aa  90.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  24.26 
 
 		 1296 aa  89.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1055 aa  85.9  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1318 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1106 aa  75.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  32.74 
 
 		 799 aa  74.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  26.6 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  32.18 
 
 		 863 aa  68.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  34.78 
 
 		 501 aa  64.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.89 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  34.39 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  30.92 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  29.11 
 
 		 536 aa  58.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  31.33 
 
 		 3066 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  29.5 
 
 		 760 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.45 
 
 		 1526 aa  57  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  28.65 
 
 		 459 aa  57  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  37.8 
 
 		 153 aa  56.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  33.57 
 
 		 483 aa  57  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1106 aa  56.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  29.48 
 
 		 446 aa  56.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1263 aa  55.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  24.48 
 
 		 417 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.28 
 
 		 456 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  27.5 
 
 		 1359 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  29 
 
 		 979 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  40.65 
 
 		 452 aa  53.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.08 
 
 		 810 aa  53.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  26.87 
 
 		 1216 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.67 
 
 		 465 aa  53.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3649  fibronectin type III domain-containing protein  26.56 
 
 		 700 aa  52.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483287  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  25.09 
 
 		 1170 aa  52.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  30.9 
 
 		 535 aa  52.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.82 
 
 		 735 aa  52  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  35.16 
 
 		 505 aa  52  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  28.87 
 
 		 454 aa  52  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  24.7 
 
 		 459 aa  51.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  44.07 
 
 		 665 aa  51.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  27.32 
 
 		 471 aa  50.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  30.95 
 
 		 462 aa  50.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  38.27 
 
 		 525 aa  50.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  31.25 
 
 		 467 aa  49.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  30.81 
 
 		 481 aa  49.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.02 
 
 		 428 aa  49.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1001 aa  48.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  28.64 
 
 		 350 aa  49.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  40.54 
 
 		 14609 aa  48.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  33.87 
 
 		 435 aa  48.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.47 
 
 		 541 aa  48.9  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  39.19 
 
 		 1394 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  42.03 
 
 		 297 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  28.24 
 
 		 476 aa  48.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1010 aa  48.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  31.25 
 
 		 477 aa  48.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  35.19 
 
 		 409 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 842 aa  47.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  41.46 
 
 		 501 aa  47.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  29.87 
 
 		 457 aa  47.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  40 
 
 		 428 aa  47  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  31.4 
 
 		 641 aa  46.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  30.89 
 
 		 588 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 674 aa  46.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.41 
 
 		 468 aa  46.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.22 
 
 		 483 aa  46.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.19 
 
 		 375 aa  46.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  29.19 
 
 		 775 aa  45.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  29.8 
 
 		 570 aa  45.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  33.06 
 
 		 460 aa  45.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>