79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1527 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  35.78 
 
 		 635 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.15 
 
 		 547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.28 
 
 		 735 aa  132  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  35.6 
 
 		 471 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.69 
 
 		 810 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  34.26 
 
 		 505 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.74 
 
 		 871 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  33.76 
 
 		 1092 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  47.5 
 
 		 641 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1001 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  40.57 
 
 		 564 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  39.35 
 
 		 954 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  30.9 
 
 		 375 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  43.84 
 
 		 638 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  44.95 
 
 		 698 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.31 
 
 		 777 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  39.24 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  41.5 
 
 		 595 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  43.75 
 
 		 810 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  46.36 
 
 		 697 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.21 
 
 		 940 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  52.38 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  54.69 
 
 		 919 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35.4 
 
 		 749 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.52 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  43.43 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  47.31 
 
 		 838 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.98 
 
 		 1035 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  41.23 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  36.21 
 
 		 709 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.62 
 
 		 1931 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  52.78 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  40.7 
 
 		 805 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  53.03 
 
 		 1056 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1121 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  30.18 
 
 		 707 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  41.18 
 
 		 724 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.73 
 
 		 820 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  31.22 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.41 
 
 		 892 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  31.29 
 
 		 582 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  32.62 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  35.38 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  24.78 
 
 		 500 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  29.95 
 
 		 620 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.01 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  40.24 
 
 		 1755 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.55 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  24.63 
 
 		 1300 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  34.65 
 
 		 467 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  31.45 
 
 		 520 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  30.39 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  30.39 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.09 
 
 		 510 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  22.6 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  27.17 
 
 		 899 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  30 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  27.52 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  25.83 
 
 		 570 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28.81 
 
 		 759 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 550 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  30.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  32.64 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  22.7 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  30.69 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1066 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.39 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.86 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  36.84 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  27.84 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  26.13 
 
 		 677 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  28.87 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.6 
 
 		 442 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  32.88 
 
 		 536 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  40.74 
 
 		 1025 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  33.96 
 
 		 404 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>