136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2670 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1284    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  66.67 
 
 		 940 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  55.36 
 
 		 771 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  56.76 
 
 		 1096 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  51.67 
 
 		 747 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  53.54 
 
 		 586 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  39.13 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.42 
 
 		 861 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  37.12 
 
 		 871 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  44.05 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.09 
 
 		 735 aa  170  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.49 
 
 		 810 aa  160  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  36.54 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  41.85 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  41.21 
 
 		 656 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.92 
 
 		 1001 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  37.07 
 
 		 525 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  31.31 
 
 		 375 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  43.04 
 
 		 631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  44.74 
 
 		 926 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  34.02 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  36.12 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  33.77 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  37.04 
 
 		 564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  39.22 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.29 
 
 		 1092 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  33.85 
 
 		 641 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.93 
 
 		 2552 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.32 
 
 		 960 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.48 
 
 		 777 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  33.47 
 
 		 954 aa  97.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  35.1 
 
 		 435 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  38.64 
 
 		 297 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.41 
 
 		 709 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 168 aa  94.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.93 
 
 		 1931 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  36.43 
 
 		 433 aa  90.9  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  29.68 
 
 		 1021 aa  88.2  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  30.27 
 
 		 838 aa  84  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  39.44 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.05 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  31.46 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.16 
 
 		 724 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  28.09 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  26.55 
 
 		 698 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  33.12 
 
 		 1351 aa  80.5  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  34 
 
 		 245 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.61 
 
 		 1035 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.41 
 
 		 820 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  30.43 
 
 		 638 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  32.64 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1121 aa  77  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.71 
 
 		 892 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  32.49 
 
 		 570 aa  77  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  34.26 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 919 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.49 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.89 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  39.09 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.96 
 
 		 810 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.95 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  29.44 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  41.38 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.42 
 
 		 341 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4209  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.19 
 
 		 1618 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  28.51 
 
 		 749 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.1 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.86 
 
 		 1200 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  31.09 
 
 		 294 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  23.12 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  29.82 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  28.16 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  35.54 
 
 		 1755 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.45 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.86 
 
 		 2272 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  28.9 
 
 		 360 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.63 
 
 		 1783 aa  55.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  27.7 
 
 		 429 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.45 
 
 		 510 aa  54.3  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.52 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.98 
 
 		 2036 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  46.77 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.55 
 
 		 1969 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.57 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.57 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  34.03 
 
 		 550 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.99 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  40.22 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  25 
 
 		 707 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  23.78 
 
 		 1300 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.73 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  27.06 
 
 		 1384 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.93 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.48 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1920  hypothetical protein  62.5 
 
 		 101 aa  51.2  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  24.58 
 
 		 439 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  24.84 
 
 		 671 aa  50.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.9 
 
 		 400 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.92 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 882 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>