157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1838 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1035 aa  2038    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  43.12 
 
 		 1799 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  43.59 
 
 		 1234 aa  360  7e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.26 
 
 		 930 aa  325  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  33.67 
 
 		 954 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  40.07 
 
 		 1262 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  40.46 
 
 		 749 aa  277  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  36.21 
 
 		 461 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  46.45 
 
 		 1056 aa  252  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  31.14 
 
 		 919 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  38.74 
 
 		 1931 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 966 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.01 
 
 		 838 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 468 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  31.74 
 
 		 526 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  35.15 
 
 		 698 aa  155  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  31.75 
 
 		 697 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  24.47 
 
 		 1391 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  33.43 
 
 		 918 aa  148  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  43.5 
 
 		 595 aa  148  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  45.18 
 
 		 581 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.79 
 
 		 1338 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.37 
 
 		 1732 aa  140  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  30.64 
 
 		 433 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.61 
 
 		 735 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.92 
 
 		 1321 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.74 
 
 		 1356 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  52.05 
 
 		 845 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  52.74 
 
 		 819 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 2554 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  52.74 
 
 		 870 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  41.12 
 
 		 875 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  49.32 
 
 		 3295 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  31.45 
 
 		 724 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  49.7 
 
 		 802 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.78 
 
 		 810 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  43.33 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.27 
 
 		 982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  51.03 
 
 		 1380 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  47.83 
 
 		 823 aa  128  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  48.67 
 
 		 735 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45.21 
 
 		 786 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.63 
 
 		 719 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  48.3 
 
 		 840 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  47.27 
 
 		 522 aa  121  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.87 
 
 		 801 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 1121 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  31.6 
 
 		 620 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  41.14 
 
 		 564 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.12 
 
 		 709 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.37 
 
 		 569 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.92 
 
 		 810 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  41.23 
 
 		 940 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.88 
 
 		 863 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1167 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  44.77 
 
 		 627 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  46.62 
 
 		 1387 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.96 
 
 		 1707 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  38.82 
 
 		 798 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  32.53 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  32.82 
 
 		 471 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 739 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  28.08 
 
 		 467 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.6 
 
 		 831 aa  106  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  39.7 
 
 		 547 aa  104  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  39.79 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 1004 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  35.26 
 
 		 1132 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  32.97 
 
 		 505 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  32.69 
 
 		 294 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.74 
 
 		 635 aa  97.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  36.42 
 
 		 948 aa  97.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.65 
 
 		 1295 aa  96.3  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 		 524 aa  95.9  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  33 
 
 		 1092 aa  95.1  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.67 
 
 		 960 aa  94.7  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1001 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.65 
 
 		 933 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  32.13 
 
 		 638 aa  87.8  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  36.04 
 
 		 871 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  28.67 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.24 
 
 		 1024 aa  84.3  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  31.16 
 
 		 805 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  38.85 
 
 		 630 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  34.8 
 
 		 707 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.43 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  28.11 
 
 		 820 aa  82  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  27.86 
 
 		 892 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  36.54 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  33 
 
 		 972 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  40.74 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  25.9 
 
 		 877 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  27.49 
 
 		 673 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  33.56 
 
 		 245 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 639 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  31.32 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.86 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  29.9 
 
 		 550 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  36.94 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>