161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2494 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1233    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.9 
 
 		 1167 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  48 
 
 		 638 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  47.52 
 
 		 630 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  58.15 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  54.6 
 
 		 451 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  53.64 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  53.24 
 
 		 346 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  52.87 
 
 		 673 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  46.01 
 
 		 1302 aa  250  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  38.97 
 
 		 322 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  42.16 
 
 		 569 aa  203  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.14 
 
 		 505 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  39.93 
 
 		 1391 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  37.4 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.1 
 
 		 863 aa  194  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  42.64 
 
 		 877 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  38.89 
 
 		 982 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  38.59 
 
 		 918 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 709 aa  170  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  33.53 
 
 		 755 aa  164  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  36.47 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  33.45 
 
 		 930 aa  160  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  58.52 
 
 		 389 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  32.35 
 
 		 426 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  53.85 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  53.62 
 
 		 884 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  31.87 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  53.97 
 
 		 957 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  51.15 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  44.09 
 
 		 705 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.46 
 
 		 748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.02 
 
 		 1321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.56 
 
 		 1338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  52.03 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  50.79 
 
 		 1132 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  53.23 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  34.43 
 
 		 1707 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  56.25 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  46.75 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  49.19 
 
 		 869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.62 
 
 		 945 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.36 
 
 		 933 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  44.8 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  28.24 
 
 		 948 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  30.72 
 
 		 954 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 717 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  32.34 
 
 		 550 aa  97.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  38.17 
 
 		 853 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  25.76 
 
 		 526 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  25.76 
 
 		 1799 aa  91.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.29 
 
 		 1221 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  40.28 
 
 		 500 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  29.18 
 
 		 1262 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  36.62 
 
 		 823 aa  87.4  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.19 
 
 		 719 aa  87  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 		 819 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 		 802 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  26.71 
 
 		 1234 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.57 
 
 		 845 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.66 
 
 		 870 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.66 
 
 		 1356 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  23.53 
 
 		 1004 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  28.08 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1024 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  38.52 
 
 		 1091 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  27.6 
 
 		 1035 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  34.97 
 
 		 840 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 1380 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  30 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.13 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  38.21 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  37.04 
 
 		 965 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.02 
 
 		 1295 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.87 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  30.8 
 
 		 1444 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  35.1 
 
 		 951 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  31.36 
 
 		 928 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  35.16 
 
 		 469 aa  73.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  31.97 
 
 		 801 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  29.79 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.78 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  26.1 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  35.57 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 972 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  36.15 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  31.45 
 
 		 1015 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 1732 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  30.81 
 
 		 912 aa  67.4  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  31.62 
 
 		 798 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.04 
 
 		 618 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  33.08 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.37 
 
 		 2554 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>