106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4289 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 717 aa  1461    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  29.26 
 
 		 1004 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.06 
 
 		 1221 aa  191  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  33.02 
 
 		 626 aa  184  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  32.51 
 
 		 703 aa  164  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  28.31 
 
 		 651 aa  159  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  23.73 
 
 		 768 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  28 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  32.33 
 
 		 346 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  27.71 
 
 		 358 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 		 459 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  31.12 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  29.29 
 
 		 1302 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  28.52 
 
 		 347 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  32.84 
 
 		 426 aa  98.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  29.17 
 
 		 426 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  28.78 
 
 		 451 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32.52 
 
 		 610 aa  97.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  28.78 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.36 
 
 		 365 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  32 
 
 		 930 aa  94  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  30.34 
 
 		 630 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  30.43 
 
 		 638 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  29.62 
 
 		 322 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  27.69 
 
 		 755 aa  92  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  27 
 
 		 748 aa  90.5  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 709 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  39.26 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  29.76 
 
 		 505 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  30.24 
 
 		 505 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1167 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.46 
 
 		 1194 aa  79.7  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  26.74 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.78 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.86 
 
 		 834 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  27.68 
 
 		 984 aa  68.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  34.5 
 
 		 1199 aa  67  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.25 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.88 
 
 		 1172 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  36.57 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  27 
 
 		 551 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  40.57 
 
 		 1847 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6415  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.61 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  31.65 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2196  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.31 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  34.15 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3936  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1340 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 		 359 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.53 
 
 		 795 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 615 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  32.73 
 
 		 1123 aa  54.7  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  24.62 
 
 		 312 aa  54.3  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  22.22 
 
 		 533 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  32.26 
 
 		 869 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  28.46 
 
 		 335 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  43.21 
 
 		 948 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  34.09 
 
 		 635 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  22.71 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  33.88 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.56 
 
 		 3027 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.19 
 
 		 480 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 365 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  30.07 
 
 		 676 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  28.89 
 
 		 300 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  21.38 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  32.28 
 
 		 2068 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  30.47 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  30.47 
 
 		 356 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  32.91 
 
 		 718 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  33.68 
 
 		 2334 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  21.74 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  31.87 
 
 		 2286 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  28.47 
 
 		 444 aa  48.9  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.23 
 
 		 496 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  37.68 
 
 		 1401 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.95 
 
 		 680 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1123 aa  47.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.36 
 
 		 332 aa  47.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  37.5 
 
 		 613 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 332 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  29.71 
 
 		 741 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  29.66 
 
 		 336 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  23.85 
 
 		 543 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1933  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  32.18 
 
 		 330 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  35.21 
 
 		 1401 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  35.56 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  28.28 
 
 		 207 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.38 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0414  hypothetical protein  39.73 
 
 		 884 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  30.41 
 
 		 1160 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  43.48 
 
 		 409 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  25.25 
 
 		 480 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  33.64 
 
 		 349 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  33.64 
 
 		 349 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  33.68 
 
 		 749 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>