207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4424 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 709 aa  1452    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  85.68 
 
 		 391 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  57.98 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  52.81 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  56.68 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  52.61 
 
 		 347 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  55.37 
 
 		 462 aa  350  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  50.64 
 
 		 748 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  64.06 
 
 		 253 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  48.64 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.26 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  39.02 
 
 		 505 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  35.33 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  36.33 
 
 		 755 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  37.05 
 
 		 346 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  37.06 
 
 		 1302 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11111  cellulase celA2b  54 
 
 		 151 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.02814e-48  normal  0.503236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  35.29 
 
 		 610 aa  170  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  31.39 
 
 		 322 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  36.39 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  36.24 
 
 		 426 aa  163  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  36.75 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  35.87 
 
 		 638 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  32.11 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1167 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  38.03 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  36.87 
 
 		 1209 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  34.4 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  35.1 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  33.33 
 
 		 261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  45.71 
 
 		 492 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  49.21 
 
 		 497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  43.06 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  45.24 
 
 		 374 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  49.23 
 
 		 603 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.22 
 
 		 1072 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  44.88 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.02 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  42 
 
 		 801 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 489 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  42.15 
 
 		 634 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  45.08 
 
 		 890 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.94 
 
 		 933 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  40.6 
 
 		 373 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  39.86 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  41.91 
 
 		 479 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  37.06 
 
 		 801 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  44.27 
 
 		 368 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  41.18 
 
 		 801 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.57 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.65 
 
 		 627 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  42.06 
 
 		 548 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  40.56 
 
 		 384 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  42.5 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.79 
 
 		 803 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  45.97 
 
 		 423 aa  95.1  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  42.48 
 
 		 1128 aa  94.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.89 
 
 		 498 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  44.63 
 
 		 452 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  41.67 
 
 		 535 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  44.72 
 
 		 732 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.99 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.09 
 
 		 574 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  44.53 
 
 		 417 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40.95 
 
 		 1207 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.2 
 
 		 472 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  37.12 
 
 		 461 aa  90.9  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.02 
 
 		 426 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.2 
 
 		 380 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 468 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.73 
 
 		 717 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.1 
 
 		 500 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.21 
 
 		 489 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  41.59 
 
 		 446 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  37.6 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.27 
 
 		 568 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24.68 
 
 		 626 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.15 
 
 		 436 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  37.12 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1503  Cellulase  27.52 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.299895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  36.22 
 
 		 488 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  30.28 
 
 		 264 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  35.77 
 
 		 414 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00452  Putative uncharacterized proteinXyloglucan-specific endoglucanase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BG78]  31.34 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.31 
 
 		 567 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.35 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.93 
 
 		 1221 aa  75.1  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  25.82 
 
 		 1004 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 		 703 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.69 
 
 		 165 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  34.01 
 
 		 642 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.4 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  38.53 
 
 		 794 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  26.85 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.48 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  22.98 
 
 		 1194 aa  67.8  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.44 
 
 		 695 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>