122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1404 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1404  cellulase  100 
 
 		 457 aa  935    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  53.29 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  62.27 
 
 		 638 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  59.7 
 
 		 630 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  65.07 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.64 
 
 		 610 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  42.69 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  39.26 
 
 		 1302 aa  236  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  45.39 
 
 		 1167 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  35.69 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  32.63 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  32.53 
 
 		 505 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  35.02 
 
 		 930 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  28.4 
 
 		 755 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 		 709 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  31.23 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  31.76 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  33.19 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  30.58 
 
 		 748 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.3 
 
 		 1221 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  34.29 
 
 		 717 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  65.62 
 
 		 1707 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  26.97 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  52.75 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  57.97 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  30.66 
 
 		 703 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  49.44 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  26.33 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.41 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  60.66 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  56.52 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  60 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  52.94 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  53.45 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  57.38 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  43.36 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  55.74 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  56.06 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  50.79 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  54.69 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  50.85 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  23.05 
 
 		 1004 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  40.91 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25.56 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  46.51 
 
 		 1918 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25.43 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  47.22 
 
 		 1335 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.07 
 
 		 1194 aa  60.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  51.67 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.32 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25.1 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  30.16 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  50 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 510 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  44.78 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  25 
 
 		 1414 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  21.99 
 
 		 768 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.56 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 335 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  48.89 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  29.25 
 
 		 1127 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  29.25 
 
 		 1127 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.28 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.44 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  40 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  29.38 
 
 		 792 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.77 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.26 
 
 		 869 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.55 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6987  OmpA/MotB domain protein  46.88 
 
 		 514 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146113  hitchhiker  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  65.52 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25 
 
 		 673 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.96 
 
 		 545 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  44.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  23.17 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  41.51 
 
 		 1053 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  66.67 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25 
 
 		 332 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.22 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  24.73 
 
 		 853 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 814 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  63.33 
 
 		 335 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  37.5 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>