229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1656 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 951 aa  1944    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  67.12 
 
 		 965 aa  1335    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  31.42 
 
 		 2286 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  73.82 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  65.96 
 
 		 509 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  65.79 
 
 		 524 aa  261  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  62.11 
 
 		 1015 aa  237  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  55.39 
 
 		 928 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  59.07 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  61.26 
 
 		 1122 aa  230  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  56.06 
 
 		 501 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  56.62 
 
 		 1164 aa  221  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 		 541 aa  219  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  54.97 
 
 		 746 aa  213  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  53.62 
 
 		 536 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  52.88 
 
 		 780 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  55.03 
 
 		 535 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  27.57 
 
 		 839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  27.78 
 
 		 627 aa  194  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  48.26 
 
 		 629 aa  191  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.9 
 
 		 801 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  25.72 
 
 		 832 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 1049 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  50.25 
 
 		 533 aa  173  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  25.29 
 
 		 838 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  25.12 
 
 		 722 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 683 aa  151  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  57.5 
 
 		 679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  52.67 
 
 		 912 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  26.53 
 
 		 648 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  25.32 
 
 		 1011 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  41.75 
 
 		 837 aa  137  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  37.38 
 
 		 630 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  47.58 
 
 		 464 aa  131  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  51.24 
 
 		 618 aa  130  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  42.77 
 
 		 1290 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  49.24 
 
 		 469 aa  125  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  49.23 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  25.62 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  48.82 
 
 		 479 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  48.84 
 
 		 566 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  24.08 
 
 		 788 aa  108  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  44.44 
 
 		 479 aa  105  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  24.23 
 
 		 791 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.32 
 
 		 945 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  38.52 
 
 		 1186 aa  92  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.74 
 
 		 953 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.29 
 
 		 630 aa  88.6  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.34 
 
 		 789 aa  88.2  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1024 aa  82.4  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  24.86 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  38.76 
 
 		 1444 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  40.48 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.22 
 
 		 1505 aa  76.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  22.77 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  39.1 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  24.14 
 
 		 708 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  35.1 
 
 		 610 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  24.38 
 
 		 709 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  38.71 
 
 		 877 aa  74.7  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.59 
 
 		 957 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  32 
 
 		 884 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  38.89 
 
 		 863 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  40.31 
 
 		 389 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1121 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.29 
 
 		 1132 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.92 
 
 		 982 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  55 
 
 		 311 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.48 
 
 		 790 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  40.4 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  51.43 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 423 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  36.11 
 
 		 1391 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.1 
 
 		 842 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0171  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1117 aa  69.3  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  34.29 
 
 		 673 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.1 
 
 		 639 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.85 
 
 		 571 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1167 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.38 
 
 		 988 aa  66.6  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.61 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  47.62 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30.46 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  36.13 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  44.44 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  53.42 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  61.02 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  29.61 
 
 		 401 aa  64.3  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  20.92 
 
 		 677 aa  62  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  52.17 
 
 		 949 aa  62  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.14 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  44.74 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  48.61 
 
 		 737 aa  61.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>