24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5089 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  74.91 
 
 
788 aa  1146    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 
791 aa  1580    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  34.69 
 
 
648 aa  270  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  29.88 
 
 
1011 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  31.38 
 
 
839 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.53 
 
 
801 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  33.46 
 
 
563 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  29.24 
 
 
580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  31.56 
 
 
1049 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  24.95 
 
 
832 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  26.72 
 
 
722 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  23.71 
 
 
627 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  24.5 
 
 
965 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  24.35 
 
 
951 aa  100  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  22.83 
 
 
838 aa  90.9  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.29 
 
 
1121 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.12 
 
 
708 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  28.86 
 
 
709 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.42 
 
 
2286 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.43 
 
 
644 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.76 
 
 
789 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.76 
 
 
677 aa  51.6  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  28.98 
 
 
1302 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  38.05 
 
 
689 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.157954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>