More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2972 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 683 aa  1399    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  69.1 
 
 		 298 aa  350  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  52.15 
 
 		 308 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  57.26 
 
 		 357 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  46.43 
 
 		 356 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  62.09 
 
 		 679 aa  249  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  55.79 
 
 		 837 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  60.3 
 
 		 235 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  56.72 
 
 		 239 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  56.72 
 
 		 239 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  57.35 
 
 		 630 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  55.44 
 
 		 334 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  49.11 
 
 		 338 aa  206  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  51.23 
 
 		 767 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  50.26 
 
 		 343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  48.17 
 
 		 928 aa  198  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  46.86 
 
 		 965 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  46.93 
 
 		 494 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  36.49 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  50.51 
 
 		 692 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  45.29 
 
 		 333 aa  194  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  47.27 
 
 		 428 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  50.51 
 
 		 1001 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  48.97 
 
 		 338 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  48.04 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  48.72 
 
 		 233 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  50 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  43.61 
 
 		 221 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  48.34 
 
 		 501 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  42.91 
 
 		 1160 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  45.5 
 
 		 1015 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  41.67 
 
 		 225 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.76 
 
 		 1122 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  42.53 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.12 
 
 		 604 aa  170  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  33.23 
 
 		 536 aa  168  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  32.13 
 
 		 780 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  38.52 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  43.08 
 
 		 533 aa  160  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  47.06 
 
 		 212 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  43.13 
 
 		 490 aa  152  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 951 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  46.07 
 
 		 212 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  36.33 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  39.81 
 
 		 524 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  40.37 
 
 		 629 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40.85 
 
 		 1164 aa  144  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  37.31 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 		 465 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  34.58 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.85 
 
 		 251 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 247 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 276 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 275 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 204 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.18 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.94 
 
 		 417 aa  115  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.68 
 
 		 244 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 264 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  33.76 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.09 
 
 		 1115 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  34.02 
 
 		 274 aa  112  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 273 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 299 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 		 234 aa  111  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  34.87 
 
 		 234 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 368 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 220 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 277 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  45.31 
 
 		 912 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 234 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 234 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  35.03 
 
 		 234 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.68 
 
 		 872 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  36.79 
 
 		 344 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 241 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 244 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.85 
 
 		 1115 aa  107  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.85 
 
 		 1119 aa  107  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.85 
 
 		 927 aa  107  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 234 aa  107  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>