193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3012 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 630 aa  1307    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  58.65 
 
 		 629 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  62.5 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  54.01 
 
 		 1217 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  43.1 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  39.09 
 
 		 406 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  59.8 
 
 		 679 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  57.69 
 
 		 683 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 837 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  43.05 
 
 		 928 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  26.87 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 541 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 780 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  39.82 
 
 		 746 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  40.99 
 
 		 965 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.83 
 
 		 1122 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  40.47 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  41.63 
 
 		 501 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  40.09 
 
 		 1015 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  40.48 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  37.85 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  40.29 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  37.38 
 
 		 951 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  37.13 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 1164 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  40.74 
 
 		 533 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  41.34 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  40.16 
 
 		 912 aa  94.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  65.71 
 
 		 922 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  62.5 
 
 		 591 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  67.65 
 
 		 415 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  65.15 
 
 		 600 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  58.97 
 
 		 707 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  60.81 
 
 		 411 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  62.32 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  56.52 
 
 		 590 aa  87.4  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  61.76 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  61.76 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  59.42 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  59.7 
 
 		 599 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  56.72 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  63.64 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.75 
 
 		 1051 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.23 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 		 814 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.7 
 
 		 831 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  23.68 
 
 		 726 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.48 
 
 		 688 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  58.57 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  32.4 
 
 		 1290 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  60.94 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  61.76 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  35.82 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  60 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  57.58 
 
 		 928 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  54.79 
 
 		 660 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  50 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.75 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 		 611 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  32.37 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  64.41 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.62 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  41.76 
 
 		 1186 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  53.52 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  52.86 
 
 		 895 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 1077 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  47.22 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  56.45 
 
 		 571 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  57.81 
 
 		 730 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  45.45 
 
 		 425 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  48 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  32.59 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  51.56 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  57.58 
 
 		 742 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  54.69 
 
 		 1601 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  50 
 
 		 900 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  59.38 
 
 		 961 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  52.31 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  61.02 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30.6 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.2 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  24.92 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  49.23 
 
 		 311 aa  67  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  32.09 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 		 350 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  38.16 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  54.24 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  53.12 
 
 		 1224 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  47.89 
 
 		 848 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  30.83 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  50.77 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.62 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>