More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3117 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
387 aa  782    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  56.96 
 
 
373 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  47.85 
 
 
258 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  45.16 
 
 
417 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  42.08 
 
 
320 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  41.28 
 
 
324 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  45.11 
 
 
503 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  47.62 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  47.25 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  44.15 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  45.73 
 
 
488 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.21 
 
 
413 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
522 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 
227 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  41.18 
 
 
273 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.39 
 
 
267 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
537 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  42.08 
 
 
287 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  41.44 
 
 
229 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.27 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 
321 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.49 
 
 
279 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
275 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
275 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
275 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
275 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.49 
 
 
275 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
275 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
275 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 
276 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
275 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
542 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.02 
 
 
1115 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 
409 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.62 
 
 
927 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.62 
 
 
1115 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
352 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
264 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
1115 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
242 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.71 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.65 
 
 
221 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.54 
 
 
1119 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
261 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 
1115 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.85 
 
 
271 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
264 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.06 
 
 
872 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 
213 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
295 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 
220 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
247 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
251 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 
241 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  37.84 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
281 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
430 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
1124 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
241 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 
1101 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
246 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.46 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.46 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.8 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.46 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
255 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
244 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 
238 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  38.62 
 
 
277 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
242 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
217 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.97 
 
 
244 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 
248 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.77 
 
 
241 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 
683 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
244 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
247 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>