More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0801 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
537 aa  1064    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  40.42 
 
 
520 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.6 
 
 
468 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  50 
 
 
273 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  51.2 
 
 
287 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  32.7 
 
 
488 aa  193  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 
503 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  46.04 
 
 
267 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.69 
 
 
251 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  44.02 
 
 
417 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 
292 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 
320 aa  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  42.72 
 
 
307 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
465 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  41.85 
 
 
387 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.74 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
258 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  36.95 
 
 
344 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  37.62 
 
 
291 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  40 
 
 
373 aa  137  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 
321 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
542 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 
247 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
247 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 
352 aa  133  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  38.58 
 
 
244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
276 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 
248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 
227 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.52 
 
 
1115 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.52 
 
 
1115 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.52 
 
 
1119 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
229 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.52 
 
 
927 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
255 aa  127  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
345 aa  127  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 
324 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
275 aa  126  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
1115 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
368 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  40.29 
 
 
281 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.59 
 
 
279 aa  124  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
275 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.86 
 
 
275 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  37.75 
 
 
317 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
242 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
273 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.45 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
275 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
275 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
273 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 
1115 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.19 
 
 
872 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  34.73 
 
 
273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  32.22 
 
 
295 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  35.92 
 
 
237 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
273 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.83 
 
 
250 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.27 
 
 
244 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
248 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
251 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
256 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 
263 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
273 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
272 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 
217 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.18 
 
 
271 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
405 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
345 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  35.12 
 
 
327 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.18 
 
 
321 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
213 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
219 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 
273 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
213 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
213 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
213 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.81 
 
 
267 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
275 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>