More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11117 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  62.07 
 
 
247 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  53.43 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  44.12 
 
 
287 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 
267 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 
273 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.86 
 
 
468 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  40.98 
 
 
503 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
247 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  38.58 
 
 
345 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  39.41 
 
 
522 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  41.26 
 
 
307 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
292 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  43.32 
 
 
320 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  41.21 
 
 
417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
537 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  38.35 
 
 
488 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.51 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 
542 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.44 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  41.4 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
520 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.74 
 
 
251 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 
291 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  42.02 
 
 
250 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
413 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.37 
 
 
244 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 
229 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 
220 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.32 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  35.75 
 
 
373 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.37 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
258 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
204 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.09 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  36.17 
 
 
299 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 
299 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  36.17 
 
 
299 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
247 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
242 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.43 
 
 
1001 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
285 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.69 
 
 
244 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 
352 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 
255 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.69 
 
 
440 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
256 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  33.33 
 
 
299 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
321 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
263 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01800  chitin deacetylase, putative  31.98 
 
 
470 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.33 
 
 
327 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
216 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.93 
 
 
1099 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 
283 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
305 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.42 
 
 
244 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 
252 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 
336 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.16 
 
 
353 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
258 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.33 
 
 
321 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.34 
 
 
573 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 
465 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  36.41 
 
 
692 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  32.45 
 
 
258 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
238 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  32.55 
 
 
234 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
413 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  30.14 
 
 
258 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
1002 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  30.62 
 
 
261 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
275 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>