More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4026 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 219 aa  446  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  66.21 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  61.75 
 
 		 215 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 		 212 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  61.21 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  72.57 
 
 		 175 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  45.77 
 
 		 317 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  42.71 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  38.78 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 		 317 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  41.84 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.95 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.95 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.76 
 
 		 364 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.77 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 		 259 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 275 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.71 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.01 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.18 
 
 		 373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.67 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  38.31 
 
 		 1099 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.05 
 
 		 275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  47.62 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 1101 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  39.22 
 
 		 417 aa  122  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 405 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 		 413 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 		 324 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 264 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.65 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 1124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 752 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 387 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.74 
 
 		 321 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.38 
 
 		 440 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 1118 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 537 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  31.12 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.61 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.12 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40.13 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.12 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 302 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 263 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.56 
 
 		 468 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 368 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.49 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 372 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.36 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.5 
 
 		 927 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.5 
 
 		 1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.5 
 
 		 1119 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.5 
 
 		 1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.47 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 542 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>