More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4627 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
283 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  40.23 
 
 
317 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  47.22 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.6 
 
 
251 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  43.88 
 
 
241 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  43.15 
 
 
241 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 
220 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  43.96 
 
 
285 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
213 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
213 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
213 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
219 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
241 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  40.88 
 
 
317 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 
241 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 
213 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  45.26 
 
 
413 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  42.64 
 
 
217 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  41.62 
 
 
232 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  42.64 
 
 
244 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  47.25 
 
 
259 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 
215 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 
284 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  41.45 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 
217 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  47.86 
 
 
205 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  38.93 
 
 
1101 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  44.2 
 
 
202 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.63 
 
 
364 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
216 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
405 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.43 
 
 
373 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
299 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  39.34 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
301 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  43.02 
 
 
175 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  39.04 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
275 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.11 
 
 
275 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
275 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
275 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.55 
 
 
417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.44 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.66 
 
 
573 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.68 
 
 
1099 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  39.79 
 
 
571 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
1115 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 
927 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.29 
 
 
1115 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.29 
 
 
1119 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  38.59 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
1115 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.1 
 
 
1115 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
522 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 
244 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.8 
 
 
872 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.04 
 
 
279 aa  124  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
277 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
302 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
221 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.49 
 
 
372 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 
387 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
263 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 
236 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
404 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  39.34 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
368 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
1118 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
503 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 
752 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.7 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.08 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
1124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
247 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
430 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.23 
 
 
468 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
479 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  32.81 
 
 
244 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>