More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6185 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  68.06 
 
 		 212 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  66.21 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  67.13 
 
 		 215 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  58.14 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3831  polysaccharide deacetylase  62.86 
 
 		 175 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  45.64 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  46.35 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  44.56 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.44 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  37.44 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  40.7 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  37.19 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.65 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.23 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 317 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.89 
 
 		 373 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 324 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.67 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 413 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.67 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35.45 
 
 		 364 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  33.67 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.67 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.67 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.3 
 
 		 321 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 542 aa  128  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.16 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  42.76 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.32 
 
 		 275 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  37.42 
 
 		 417 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.92 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 		 248 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 275 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.33 
 
 		 440 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.11 
 
 		 1099 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 387 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  38.75 
 
 		 405 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  38.12 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  36.06 
 
 		 1101 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 368 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.99 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  38.36 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  44.72 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  42.07 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 302 aa  118  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 		 267 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 		 752 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 		 537 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 345 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.16 
 
 		 344 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 		 354 aa  117  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  35.5 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 321 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  37.58 
 
 		 404 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  42.21 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>