More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3051 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
264 aa  543  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  42.55 
 
 
251 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  44.5 
 
 
244 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 
221 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
305 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  41.29 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.51 
 
 
241 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  41.29 
 
 
241 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  43.14 
 
 
244 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 
302 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  40.3 
 
 
244 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 
217 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
213 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
213 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
213 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.81 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  40.51 
 
 
277 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 
204 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  38.54 
 
 
413 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
404 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  40 
 
 
1115 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  40 
 
 
1119 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
1115 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.32 
 
 
1101 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  40 
 
 
927 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 
405 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.5 
 
 
1115 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 
324 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
229 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.65 
 
 
1099 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.39 
 
 
1115 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  39.25 
 
 
872 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  40.89 
 
 
264 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
283 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 
1118 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  37.62 
 
 
279 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
1124 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  37.95 
 
 
275 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 
387 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
752 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
1120 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  37.9 
 
 
1154 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
465 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.19 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  37.34 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
275 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  41.11 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.27 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  41.05 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
522 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
275 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
275 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
430 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  34.3 
 
 
417 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.58 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.15 
 
 
468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
215 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 
409 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.99 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  37.35 
 
 
240 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  34 
 
 
440 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
251 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
413 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
261 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
372 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 
248 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
1002 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 
291 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  36.5 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 
286 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.15 
 
 
253 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
217 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 
307 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 
239 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.07 
 
 
260 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>