More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0951 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
409 aa  813    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  54.97 
 
 
404 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  52.86 
 
 
413 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  51.65 
 
 
430 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 
387 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.62 
 
 
251 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  41.67 
 
 
320 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  35.48 
 
 
258 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  34.63 
 
 
261 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  36.31 
 
 
244 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
324 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.12 
 
 
247 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 
317 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  36.46 
 
 
417 aa  122  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  39.89 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  39.88 
 
 
204 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 
305 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 
221 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
244 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  37.84 
 
 
246 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.2 
 
 
220 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 
242 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.46 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
213 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
213 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
241 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
213 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 
213 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  40.38 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  39.66 
 
 
227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.31 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.98 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  37.65 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  40.26 
 
 
217 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.85 
 
 
244 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.22 
 
 
241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 
217 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  38.99 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  43.18 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  33.53 
 
 
259 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
204 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
263 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 
542 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 
243 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
286 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  32.17 
 
 
327 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 
219 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.16 
 
 
373 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
352 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 
242 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.09 
 
 
321 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  39.47 
 
 
244 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 
345 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  32.92 
 
 
299 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  38.06 
 
 
232 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
258 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
256 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  37.28 
 
 
251 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
299 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 
196 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.99 
 
 
279 aa  104  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
1124 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.72 
 
 
267 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
199 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
255 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  39.88 
 
 
252 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
299 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
251 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
262 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
228 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  36.84 
 
 
364 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 
372 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
250 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 
264 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.35 
 
 
1115 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  37.28 
 
 
479 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.35 
 
 
1119 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.35 
 
 
1115 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
752 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  31.74 
 
 
299 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
292 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  34.43 
 
 
287 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.6 
 
 
256 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
299 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  37.35 
 
 
927 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
299 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  31.74 
 
 
299 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
276 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>