More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7875 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
752 aa  1500    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  51.15 
 
 
1099 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  46.09 
 
 
637 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.89 
 
 
1119 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.89 
 
 
1115 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  38.05 
 
 
927 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.89 
 
 
1115 aa  476  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.89 
 
 
1115 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.58 
 
 
1115 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  37.91 
 
 
872 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
1101 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  39.54 
 
 
1118 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
1124 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
1154 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.85 
 
 
1120 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
1002 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
789 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
789 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
789 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
509 aa  227  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
428 aa  217  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
549 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  41.67 
 
 
421 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  41.67 
 
 
421 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  41.25 
 
 
421 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.73 
 
 
251 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  32.53 
 
 
423 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  32.83 
 
 
423 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  32.35 
 
 
422 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  32.83 
 
 
423 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  34.04 
 
 
412 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  35.56 
 
 
412 aa  162  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  36.64 
 
 
411 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  34.04 
 
 
441 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
441 aa  161  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  34.04 
 
 
441 aa  161  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  34.04 
 
 
441 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  34.04 
 
 
441 aa  161  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  32.53 
 
 
423 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  32.53 
 
 
423 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  32.53 
 
 
423 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  36.68 
 
 
442 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  33.89 
 
 
418 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  37.4 
 
 
442 aa  160  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  36.3 
 
 
461 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  32.54 
 
 
423 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
483 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  33.86 
 
 
403 aa  158  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
204 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
464 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
425 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  36.25 
 
 
451 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
479 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  35.98 
 
 
433 aa  151  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  34.42 
 
 
417 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  33.11 
 
 
424 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  32.78 
 
 
425 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  32.78 
 
 
425 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
444 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
444 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
444 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  31.73 
 
 
418 aa  145  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  29.66 
 
 
399 aa  144  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  29.66 
 
 
399 aa  144  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
495 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
420 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
410 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
470 aa  142  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
494 aa  140  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.9 
 
 
422 aa  140  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30.03 
 
 
694 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
429 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
450 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.87 
 
 
241 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.84 
 
 
633 aa  138  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
220 aa  138  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.75 
 
 
662 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
241 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
241 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.75 
 
 
505 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
1184 aa  137  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  30.94 
 
 
412 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.75 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
467 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
405 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 
213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 
213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 
213 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
464 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 
264 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
466 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.15 
 
 
213 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 
285 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  34.72 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.24 
 
 
244 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  37.73 
 
 
232 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>