More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2751 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
1118 aa  2219    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  40.11 
 
 
927 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.72 
 
 
1115 aa  780    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.94 
 
 
1115 aa  762    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.29 
 
 
1119 aa  766    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  46.35 
 
 
1124 aa  923    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
1115 aa  762    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  52.55 
 
 
1101 aa  1083    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 
1154 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.16 
 
 
1115 aa  766    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  41.6 
 
 
872 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 
1120 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
1002 aa  525  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  39.54 
 
 
752 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  41.16 
 
 
1099 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
637 aa  245  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
509 aa  210  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
549 aa  192  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  34.93 
 
 
411 aa  182  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.92 
 
 
403 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
428 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  34.58 
 
 
422 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  33.45 
 
 
461 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.05 
 
 
251 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  36.33 
 
 
421 aa  151  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  36.33 
 
 
421 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  38.96 
 
 
421 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  32.73 
 
 
433 aa  149  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  39.11 
 
 
259 aa  149  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
464 aa  148  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 
204 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  35.25 
 
 
451 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 
264 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
464 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
241 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
220 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.04 
 
 
241 aa  141  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 
241 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
213 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
213 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
425 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
213 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 
229 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 
213 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
477 aa  139  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  40.3 
 
 
413 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  36.53 
 
 
244 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
466 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
479 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
479 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
410 aa  135  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  36.57 
 
 
217 aa  135  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
475 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  35.65 
 
 
241 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
479 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
445 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  32.49 
 
 
425 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  32.49 
 
 
425 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 
422 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  29.2 
 
 
423 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  31.17 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  31.17 
 
 
412 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  31.17 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
445 aa  130  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  30.54 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  31.17 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  30.36 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  31.17 
 
 
441 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  31.22 
 
 
424 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
495 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
283 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
469 aa  128  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 
285 aa  128  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  36.12 
 
 
244 aa  127  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  32.39 
 
 
442 aa  127  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
444 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  30.16 
 
 
442 aa  127  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
399 aa  127  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
444 aa  127  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  30.28 
 
 
444 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
429 aa  126  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  27.82 
 
 
418 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  32.07 
 
 
423 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  29.96 
 
 
399 aa  125  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  29.96 
 
 
399 aa  125  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
1184 aa  125  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 
317 aa  125  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  30.8 
 
 
417 aa  125  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
475 aa  125  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  31.65 
 
 
423 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 
472 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
483 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.04 
 
 
433 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  28.85 
 
 
442 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>