More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1454 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
472 aa  960    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  48.37 
 
 
470 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 
469 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  45.1 
 
 
467 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
464 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
464 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  41.61 
 
 
1184 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 
479 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  40.58 
 
 
479 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
479 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  41.45 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
477 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
475 aa  307  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
498 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.74 
 
 
422 aa  273  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  42.82 
 
 
484 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.64 
 
 
1115 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.64 
 
 
927 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.4 
 
 
1115 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.47 
 
 
1119 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 
1115 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  29.16 
 
 
872 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 
1115 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
481 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
512 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
789 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
789 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  29 
 
 
789 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0202  putative glycosyltransferase  33.22 
 
 
483 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  32.89 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7084  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.72 
 
 
1099 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
1101 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
1118 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.32 
 
 
399 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.32 
 
 
399 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
637 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 
752 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 
1124 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 
428 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
1154 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
1120 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  29.96 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.6 
 
 
422 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
1002 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28 
 
 
461 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.12 
 
 
411 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
466 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.07 
 
 
403 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  27.27 
 
 
447 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
442 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
442 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
445 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  28.27 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.54 
 
 
694 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  26.42 
 
 
424 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  27.21 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  24.04 
 
 
452 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
410 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 
425 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.09 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  28.62 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.76 
 
 
421 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.5 
 
 
442 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 
425 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 
425 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  28.71 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.61 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.61 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.18 
 
 
442 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
412 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.92 
 
 
442 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.61 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
483 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
443 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  28.66 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  28.66 
 
 
423 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
648 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
429 aa  90.1  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
423 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
423 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
423 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  27.04 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
423 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
485 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
485 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>