More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7084 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0202  putative glycosyltransferase  93.57 
 
 
483 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  77.36 
 
 
512 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7084  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
483 aa  974    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  54.87 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
475 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
475 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
464 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
484 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.08 
 
 
472 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
466 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
464 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
479 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.67 
 
 
422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
1184 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
486 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
467 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 
1120 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.22 
 
 
1115 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
509 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 
1115 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.92 
 
 
927 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.92 
 
 
1119 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.92 
 
 
1115 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.43 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
428 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 
1101 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 
1115 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.33 
 
 
872 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.19 
 
 
403 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.93 
 
 
1118 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.77 
 
 
1099 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
423 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  29.06 
 
 
399 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  29.06 
 
 
399 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
1154 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  25.59 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
549 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
423 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.35 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
450 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
410 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
752 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 
1124 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
632 aa  90.9  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
1002 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
445 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  27.01 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 
403 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
442 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
442 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.51 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  28.76 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  24.65 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  29.74 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
425 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  26.44 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.62 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.32 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.95 
 
 
425 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.95 
 
 
425 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  27.34 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.44 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  24.93 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.09 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.76 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  28.63 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
631 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  25 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  26.57 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.09 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.09 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>