More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0420 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  97.02 
 
 
403 aa  812    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  89.14 
 
 
443 aa  789    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  99.77 
 
 
442 aa  908    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
442 aa  908    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  59.86 
 
 
424 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  54.42 
 
 
425 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  51.92 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  48.01 
 
 
441 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  46.97 
 
 
450 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.62 
 
 
927 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.62 
 
 
1115 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
1115 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.45 
 
 
872 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.35 
 
 
1119 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.94 
 
 
1115 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 
1115 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.43 
 
 
1099 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
479 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
752 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
464 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
479 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
479 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
470 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
1002 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
1120 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 
1101 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
423 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 
1154 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 
1118 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
477 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.73 
 
 
1124 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
509 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.52 
 
 
422 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  29.13 
 
 
441 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
441 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  29.13 
 
 
441 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  29.13 
 
 
441 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  29.13 
 
 
441 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  29.1 
 
 
412 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  29.13 
 
 
412 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
445 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 
1184 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.54 
 
 
403 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
637 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
484 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
433 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.57 
 
 
472 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.13 
 
 
410 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  24.34 
 
 
452 aa  99.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.71 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.14 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
475 aa  96.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.5 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.44 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.82 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.82 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
466 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
632 aa  93.6  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
420 aa  93.6  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25 
 
 
442 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  27.3 
 
 
433 aa  91.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
475 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.77 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  29.01 
 
 
433 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  29.21 
 
 
433 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.55 
 
 
433 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  23.16 
 
 
498 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  29.21 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  29.21 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.75 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  29.96 
 
 
433 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.68 
 
 
451 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
481 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24.05 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.05 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  24.05 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.49 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.98 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.98 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 
789 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 
789 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 
789 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.46 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.46 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  22.87 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>