More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3641 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
423 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  98.35 
 
 
423 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  28.13 
 
 
424 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  28.27 
 
 
437 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  28.04 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.52 
 
 
403 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.04 
 
 
1099 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  36.24 
 
 
411 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
450 aa  122  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.37 
 
 
872 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 
1120 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 
1115 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
509 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.95 
 
 
1115 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.27 
 
 
1115 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
428 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
1154 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 
752 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.27 
 
 
927 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
443 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.53 
 
 
1119 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.2 
 
 
403 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 
1124 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.72 
 
 
1115 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 
1101 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
445 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
410 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
484 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
479 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
464 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
479 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
1002 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  32.08 
 
 
461 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
466 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
479 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.93 
 
 
399 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.83 
 
 
442 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
426 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.93 
 
 
399 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
445 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
483 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.3 
 
 
442 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
512 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
415 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
464 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  32.43 
 
 
418 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.02 
 
 
422 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
445 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
466 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
475 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  30.04 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  30.04 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  30.04 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.06 
 
 
433 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  29.34 
 
 
423 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
658 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  24.25 
 
 
478 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
433 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  29.54 
 
 
423 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.93 
 
 
412 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  31.53 
 
 
441 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  31.53 
 
 
441 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
441 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  31.53 
 
 
441 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  31.53 
 
 
441 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  31.53 
 
 
412 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  31.53 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  29.34 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  29.34 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  24.5 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25.2 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.2 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.2 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  26.84 
 
 
442 aa  97.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 
477 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  29.03 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
472 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
469 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
648 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
345 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.93 
 
 
433 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.93 
 
 
433 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  27.76 
 
 
452 aa  93.2  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  28.38 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  29.86 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.82 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.63 
 
 
425 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>