More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0548 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1002 aa  2047    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.3 
 
 		 1115 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.07 
 
 		 1115 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 		 1115 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.2 
 
 		 1115 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.3 
 
 		 1119 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.72 
 
 		 927 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.57 
 
 		 872 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 1124 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 1118 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 1101 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 1154 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.25 
 
 		 1120 aa  489  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 752 aa  361  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 789 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.04 
 
 		 1099 aa  333  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 637 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 509 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  35.66 
 
 		 403 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  31.45 
 
 		 411 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  35.71 
 
 		 461 aa  160  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 		 428 aa  158  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 483 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  35.92 
 
 		 425 aa  152  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  35.92 
 
 		 425 aa  152  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.72 
 
 		 422 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  36.78 
 
 		 424 aa  151  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 429 aa  150  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  32.88 
 
 		 412 aa  142  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.13 
 
 		 399 aa  142  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.13 
 
 		 399 aa  142  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 		 425 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  30.15 
 
 		 417 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 		 423 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 		 423 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 466 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 		 423 aa  138  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 464 aa  138  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  34.21 
 
 		 441 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 441 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  34.21 
 
 		 412 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  34.21 
 
 		 441 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  34.21 
 
 		 441 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  34.21 
 
 		 412 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  34.21 
 
 		 441 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  33.47 
 
 		 423 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  33.89 
 
 		 421 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  33.47 
 
 		 423 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 410 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  33.47 
 
 		 423 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 632 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  33.89 
 
 		 421 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  33.89 
 
 		 421 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  33.47 
 
 		 423 aa  134  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  29.67 
 
 		 418 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.99 
 
 		 694 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  30.74 
 
 		 418 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 479 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 475 aa  129  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  29.63 
 
 		 442 aa  128  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 		 422 aa  128  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  29.43 
 
 		 433 aa  128  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 479 aa  128  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  29.92 
 
 		 442 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 479 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 445 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 464 aa  124  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  29.66 
 
 		 451 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 498 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 264 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 466 aa  121  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 470 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 1184 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  31.28 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  31.28 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  31.28 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 471 aa  119  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 483 aa  118  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  27.66 
 
 		 425 aa  118  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  33.75 
 
 		 244 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 395 aa  117  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 399 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 446 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 420 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 520 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 509 aa  115  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  33.61 
 
 		 520 aa  115  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.61 
 
 		 505 aa  115  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.44 
 
 		 633 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 520 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 509 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 520 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 442 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 442 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>