More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  51.15 
 
 
752 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  100 
 
 
1099 aa  2182    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  38.54 
 
 
927 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  38.38 
 
 
1115 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  38.38 
 
 
1119 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
1115 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  38.22 
 
 
1115 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  38.38 
 
 
1115 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  38.06 
 
 
872 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  41.62 
 
 
1118 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
1101 aa  419  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  37.27 
 
 
1154 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  44.69 
 
 
637 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.75 
 
 
1120 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  37.79 
 
 
1124 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
1002 aa  359  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
789 aa  323  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
789 aa  323  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
789 aa  323  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  41.35 
 
 
390 aa  222  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  41.35 
 
 
390 aa  217  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  35.13 
 
 
509 aa  202  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 
428 aa  200  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3827  acyltransferase 3  43.41 
 
 
401 aa  193  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3448  acyltransferase 3  42.22 
 
 
420 aa  189  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
549 aa  177  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  40.51 
 
 
421 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  40.51 
 
 
421 aa  172  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  40.51 
 
 
421 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  40.39 
 
 
204 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  40.61 
 
 
461 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  37.05 
 
 
442 aa  163  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  32.89 
 
 
411 aa  161  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  37.34 
 
 
442 aa  159  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  36.75 
 
 
403 aa  158  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  37.55 
 
 
451 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.28 
 
 
251 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  36.36 
 
 
422 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
479 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
464 aa  155  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  33.58 
 
 
412 aa  155  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
425 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
444 aa  154  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
444 aa  154  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
444 aa  154  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  35.5 
 
 
441 aa  154  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
441 aa  154  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
479 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  35.5 
 
 
441 aa  154  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  35.32 
 
 
433 aa  153  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
441 aa  154  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
441 aa  154  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  41.58 
 
 
285 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  35.5 
 
 
412 aa  153  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
479 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  34.63 
 
 
418 aa  150  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  35.71 
 
 
423 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  29.8 
 
 
399 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  29.8 
 
 
399 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  35.71 
 
 
423 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 
464 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 
317 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  34.5 
 
 
423 aa  147  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
264 aa  145  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  34.92 
 
 
423 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  34.92 
 
 
423 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  34.92 
 
 
423 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
405 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  34.13 
 
 
423 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
220 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
241 aa  141  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  30.45 
 
 
424 aa  140  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
213 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
213 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
213 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
241 aa  140  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 
213 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.29 
 
 
241 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.99 
 
 
412 aa  139  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  32.49 
 
 
418 aa  139  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 
417 aa  139  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
495 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
429 aa  137  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  32.51 
 
 
425 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  32.51 
 
 
425 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 
244 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
275 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
275 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
275 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
305 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
275 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
275 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
658 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
410 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
229 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 
199 aa  136  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
484 aa  136  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38.62 
 
 
275 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 
470 aa  135  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  38.62 
 
 
276 aa  135  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>