More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1449 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  100 
 
 		 251 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  48.54 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 220 aa  235  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  48.05 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  52.4 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  46.86 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  47.01 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  47.56 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  42.55 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  46.23 
 
 		 204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  40.52 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  46.63 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  47.12 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  44.66 
 
 		 321 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  42.21 
 
 		 302 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  45.13 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  43.55 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  41.58 
 
 		 320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  45.59 
 
 		 573 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  38.53 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  43.65 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.73 
 
 		 752 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  43.46 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  42.57 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  43.39 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  42.33 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 		 1101 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  42.7 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.6 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  42.35 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  45 
 
 		 354 aa  161  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  40.69 
 
 		 537 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  41.58 
 
 		 405 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  42 
 
 		 1115 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  42 
 
 		 1119 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  42 
 
 		 1115 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  43.01 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  42 
 
 		 927 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 		 368 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  41.27 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.28 
 
 		 1099 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 		 1115 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  40.5 
 
 		 1115 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  39.32 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 		 465 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  41.24 
 
 		 522 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  40.5 
 
 		 872 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 		 324 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  43.14 
 
 		 571 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 292 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  40.2 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  40.31 
 
 		 417 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  38.16 
 
 		 1124 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  38.81 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 404 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 		 353 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 317 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  42.55 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  39.05 
 
 		 1118 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 215 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 1120 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.86 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.58 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 542 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  38.57 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 		 387 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  39.27 
 
 		 440 aa  145  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.78 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  39.06 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.12 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  39 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.71 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.03 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  38.25 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.46 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 522 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>