More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2705 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 242 aa  503  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  54.38 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  49.77 
 
 		 352 aa  204  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.71 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  44.16 
 
 		 373 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  43.01 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  40.32 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  41.9 
 
 		 542 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 		 387 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 		 503 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  41.21 
 
 		 299 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  41.44 
 
 		 488 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  37.63 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  38 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  37.82 
 
 		 417 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  38 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  39.52 
 
 		 522 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  37 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  37 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  37 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  37 
 
 		 275 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  41.08 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 320 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  38.12 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.17 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 537 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  39.27 
 
 		 468 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 413 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 405 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 		 353 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  38.66 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 372 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 522 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  37.57 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.83 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3747  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000014318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  33.53 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.92 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 365 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 409 aa  111  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.53 
 
 		 1115 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  40.44 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.03 
 
 		 927 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.03 
 
 		 1115 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.03 
 
 		 1119 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.03 
 
 		 1115 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.21 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.29 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  38.92 
 
 		 465 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  27.19 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.1 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 		 752 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 345 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.03 
 
 		 872 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  32.74 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  31.31 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>