More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2167 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  97.12 
 
 		 261 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  44.08 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  41.04 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.47 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  37.19 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  33.19 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  36.68 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  36.68 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.48 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  34.67 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  34.67 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.5 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  35.23 
 
 		 279 aa  123  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 413 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.77 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  34.17 
 
 		 299 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.35 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  34.65 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  34.47 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.8 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.3 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 705 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.38 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 537 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 317 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0351  polysaccharide deacetylase  42.38 
 
 		 176 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 302 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 542 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 465 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  32.21 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  30.98 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.01 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.04 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  30.98 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  30.98 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  30.98 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.72 
 
 		 417 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 352 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.25 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  29.69 
 
 		 488 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.1 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  29.86 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>