More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3069 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
465 aa  959    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  47.69 
 
 
291 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  43.96 
 
 
344 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 
267 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  45.16 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  44.62 
 
 
373 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  41.54 
 
 
503 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
320 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
258 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  43.08 
 
 
273 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  41.05 
 
 
488 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43.3 
 
 
307 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.62 
 
 
251 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.51 
 
 
468 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
537 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  40.88 
 
 
292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  37.91 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  42.05 
 
 
287 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
327 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
275 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
204 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  38.77 
 
 
244 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 
239 aa  140  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  41.88 
 
 
239 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
275 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
275 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
276 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.95 
 
 
275 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.65 
 
 
275 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
275 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
275 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
227 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  37.24 
 
 
683 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 
275 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
264 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
220 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
241 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  35.15 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
213 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
213 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
213 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
235 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
213 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
217 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
247 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
241 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.65 
 
 
241 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  37.13 
 
 
302 aa  130  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 
277 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.94 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
221 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.86 
 
 
291 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 
542 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
244 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
301 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.2 
 
 
1115 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 
321 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.38 
 
 
1115 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  39.38 
 
 
1115 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 
352 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  39.38 
 
 
1119 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  38.86 
 
 
872 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  39.38 
 
 
927 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.64 
 
 
241 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
256 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.9 
 
 
1115 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
465 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  35.61 
 
 
248 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 
251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
263 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  35.98 
 
 
258 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
308 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
247 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
752 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 
261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  37.21 
 
 
692 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 
215 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
255 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.5 
 
 
250 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  28.97 
 
 
327 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
264 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.81 
 
 
279 aa  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
199 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  33.85 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
232 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
229 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  36.02 
 
 
237 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
372 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.13 
 
 
321 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>