More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0633 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  38.92 
 
 
503 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
292 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  40.53 
 
 
291 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  41.03 
 
 
287 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.1 
 
 
468 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  40.87 
 
 
307 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  38.92 
 
 
273 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  40.64 
 
 
320 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
247 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  40.98 
 
 
417 aa  138  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
522 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
520 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 
537 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  37 
 
 
291 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
345 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.2 
 
 
368 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
255 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 
299 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.79 
 
 
241 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
244 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  38.74 
 
 
244 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
217 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  35.47 
 
 
488 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.27 
 
 
373 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.83 
 
 
250 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  32.84 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  33.87 
 
 
279 aa  122  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.31 
 
 
241 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
430 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
465 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  36.13 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.07 
 
 
573 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  40.8 
 
 
692 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
317 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
387 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.12 
 
 
301 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  34.07 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.2 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  35.35 
 
 
237 aa  115  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
234 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
234 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.51 
 
 
234 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  34.09 
 
 
571 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.98 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 
354 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.71 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
234 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  32.98 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.71 
 
 
440 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  35.87 
 
 
413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.12 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
352 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.29 
 
 
244 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.38 
 
 
275 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 
264 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  33.15 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.06 
 
 
1001 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  33.63 
 
 
280 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
258 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
275 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  33.15 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.34 
 
 
481 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>