More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 
571 aa  1172    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  46.29 
 
 
354 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.19 
 
 
573 aa  313  5.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.87 
 
 
440 aa  169  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  43.14 
 
 
251 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  39.09 
 
 
305 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
220 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 
241 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.79 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 
277 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  39.59 
 
 
302 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
213 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
213 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
213 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
213 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 
244 aa  127  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
241 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.63 
 
 
241 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.36 
 
 
279 aa  125  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
217 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  36.14 
 
 
244 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
321 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  36.68 
 
 
320 aa  123  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 
413 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 
259 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
273 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.16 
 
 
241 aa  120  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  38.65 
 
 
353 aa  116  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
216 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.74 
 
 
364 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
247 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34 
 
 
247 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
264 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 
317 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
522 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 
417 aa  110  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
1115 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.29 
 
 
1115 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  34.29 
 
 
1119 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
1115 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.29 
 
 
927 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
307 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  33.68 
 
 
244 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.29 
 
 
872 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
229 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
284 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
299 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
301 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  32.34 
 
 
373 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.32 
 
 
468 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 
258 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.31 
 
 
244 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
212 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 
368 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
240 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 
1115 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.67 
 
 
275 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.84 
 
 
250 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.34 
 
 
244 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.51 
 
 
287 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
204 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  30.14 
 
 
202 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 
1101 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.99 
 
 
1099 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
275 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
264 aa  101  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 
1124 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 
274 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
267 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 
344 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
221 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
276 aa  98.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
275 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 
752 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
275 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 
372 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 
522 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  35.12 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.66 
 
 
275 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 
215 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
217 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
219 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.95 
 
 
271 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.95 
 
 
321 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  28.5 
 
 
260 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
789 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
789 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 
789 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 
382 aa  93.6  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28 
 
 
260 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  31.7 
 
 
240 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 
1120 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 
1118 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>