More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1932 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
522 aa  1035    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  40.8 
 
 
488 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  47.55 
 
 
267 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.54 
 
 
468 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  45.5 
 
 
503 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  49.23 
 
 
273 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  40.5 
 
 
292 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  49.26 
 
 
287 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
537 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  43 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 
291 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  42.78 
 
 
417 aa  166  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  40.44 
 
 
373 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  41.3 
 
 
387 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  42.16 
 
 
320 aa  153  8e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 
344 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
258 aa  150  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.69 
 
 
291 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  40.34 
 
 
542 aa  143  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 
247 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
405 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.77 
 
 
251 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 
275 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
520 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
368 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  38.17 
 
 
275 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.76 
 
 
279 aa  136  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  40.31 
 
 
248 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  36.08 
 
 
373 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
247 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  37.82 
 
 
273 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 
255 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 
273 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  37.7 
 
 
264 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
273 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
321 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
273 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.52 
 
 
242 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 
327 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
345 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.36 
 
 
229 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
272 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
256 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
273 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.64 
 
 
250 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
273 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38.22 
 
 
683 aa  123  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
227 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
221 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  40.54 
 
 
275 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
305 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  33.98 
 
 
244 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  40.54 
 
 
275 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
275 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 
281 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
235 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  39.89 
 
 
275 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
277 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 
261 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
251 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  34.54 
 
 
237 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 
199 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
248 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
204 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
239 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
413 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
239 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 
262 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 
324 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.11 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 
213 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>