More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0286 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 308 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  52.15 
 
 		 683 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0450  polysaccharide deacetylase  53.14 
 
 		 235 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000380571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  50.48 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.52 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 522 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  32.63 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  33.49 
 
 		 417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  33.68 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  34.02 
 
 		 488 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 204 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.55 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.31 
 
 		 1099 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  34.21 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 213 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  33.5 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 241 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 1115 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  33.96 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.03 
 
 		 927 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.42 
 
 		 872 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.6 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.03 
 
 		 1115 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.03 
 
 		 1115 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.03 
 
 		 1119 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 413 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.23 
 
 		 1101 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.58 
 
 		 1115 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 199 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 405 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 229 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 372 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  31.28 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  33.51 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 215 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  30 
 
 		 573 aa  89  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 1154 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 217 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 240 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 258 aa  85.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  31.47 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  29.52 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.38 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.02 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.5 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>