More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0662 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  100 
 
 
468 aa  934    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  40.47 
 
 
537 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 
520 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 
522 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  34.03 
 
 
488 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  41.45 
 
 
503 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  52.88 
 
 
287 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  48.58 
 
 
307 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  48.25 
 
 
267 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  48.29 
 
 
273 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  41.79 
 
 
417 aa  169  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  47.25 
 
 
387 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  45.65 
 
 
320 aa  160  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  44.83 
 
 
248 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
292 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  43.56 
 
 
247 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  32.36 
 
 
291 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  40.4 
 
 
465 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  38.79 
 
 
291 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  40.21 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 
247 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  40.66 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  40.1 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
344 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 
345 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
305 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  40.72 
 
 
542 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 
227 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.5 
 
 
251 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
256 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  41.08 
 
 
258 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  34.59 
 
 
279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 
221 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  43.41 
 
 
229 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 
372 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01852  Chitin deacetylasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.41); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BC78]  42.62 
 
 
249 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  38.62 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 
244 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
275 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.47 
 
 
275 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
275 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
275 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.95 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.12 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
240 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2661  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.06 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000138252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  41.49 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2990  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000426534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  33.06 
 
 
275 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
275 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  36.02 
 
 
273 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 
264 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
276 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
273 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
302 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 
275 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
273 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
272 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
273 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 
275 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  38.79 
 
 
237 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 
238 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 
352 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
275 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2294  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
260 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923024  unclonable  2.97243e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
251 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
273 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  39.57 
 
 
277 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.1 
 
 
250 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
264 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 
261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2736  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 
275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000182255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
273 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
242 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  36.63 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.44 
 
 
299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 
255 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.56 
 
 
573 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
273 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 
247 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
204 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  36 
 
 
243 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>